Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVC6

TMEM109, Transmembrane protein 109, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM109Q9BVC6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM109Q9BVC6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM109Q9BVC6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM109Q9BVC6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM109Q9BVC6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM109Q9BVC6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM109Q9BVC6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM109Q9BVC6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM109Q9BVC6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM109Q9BVC6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM109Q9BVC6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM109Q9BVC6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM109Q9BVC6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM109Q9BVC6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM109Q9BVC6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM109Q9BVC6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM109Q9BVC6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM109Q9BVC6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM109Q9BVC6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM109Q9BVC6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM109Q9BVC6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM109Q9BVC6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM109Q9BVC6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM109Q9BVC6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM109Q9BVC6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM109Q9BVC6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM109Q9BVC6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM109Q9BVC6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMEM109Q9BVC6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMEM109Q9BVC6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMEM109Q9BVC6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM109Q9BVC6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM109Q9BVC6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM109Q9BVC6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM109Q9BVC6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM109Q9BVC6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM109Q9BVC6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM109Q9BVC6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM109Q9BVC6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM109Q9BVC6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM109Q9BVC6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM109Q9BVC6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM109Q9BVC6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM109Q9BVC6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM109Q9BVC6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM109Q9BVC6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM109Q9BVC6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM109Q9BVC6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM109Q9BVC6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM109Q9BVC6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM109Q9BVC6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM109Q9BVC6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM109Q9BVC6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM109Q9BVC6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM109Q9BVC6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM109Q9BVC6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM109Q9BVC6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM109Q9BVC6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM109Q9BVC6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM109Q9BVC6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM109Q9BVC6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM109Q9BVC6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM109Q9BVC6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM109Q9BVC6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM109Q9BVC6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM109Q9BVC6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM109Q9BVC6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM109Q9BVC6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM109Q9BVC6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM109Q9BVC6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM109Q9BVC6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
TMEM109Q9BVC6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM109Q9BVC6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM109Q9BVC6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM109Q9BVC6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM109Q9BVC6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM109Q9BVC6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM109Q9BVC6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM109Q9BVC6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM109Q9BVC6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM109Q9BVC6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM109Q9BVC6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM109Q9BVC6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TMEM109Q9BVC6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM109Q9BVC6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM109Q9BVC6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM109Q9BVC6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM109Q9BVC6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM109Q9BVC6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM109Q9BVC6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM109Q9BVC6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM109Q9BVC6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM109Q9BVC6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM109Q9BVC6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM109Q9BVC6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM109Q9BVC6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM109Q9BVC6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM109Q9BVC6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM109Q9BVC6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM109Q9BVC6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms