Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF5

TUBB6, Tubulin beta-6 chain, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB6Q9BUF5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBB6Q9BUF5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBB6Q9BUF5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBB6Q9BUF5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBB6Q9BUF5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBB6Q9BUF5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBB6Q9BUF5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBB6Q9BUF5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBB6Q9BUF5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBB6Q9BUF5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBB6Q9BUF5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBB6Q9BUF5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBB6Q9BUF5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBB6Q9BUF5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBB6Q9BUF5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBB6Q9BUF5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBB6Q9BUF5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBB6Q9BUF5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBB6Q9BUF5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBB6Q9BUF5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBB6Q9BUF5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBB6Q9BUF5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBB6Q9BUF5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBB6Q9BUF5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBB6Q9BUF5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBB6Q9BUF5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBB6Q9BUF5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBB6Q9BUF5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBB6Q9BUF5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBB6Q9BUF5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBB6Q9BUF5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBB6Q9BUF5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBB6Q9BUF5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBB6Q9BUF5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBB6Q9BUF5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBB6Q9BUF5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBB6Q9BUF5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBB6Q9BUF5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBB6Q9BUF5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBB6Q9BUF5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBB6Q9BUF5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBB6Q9BUF5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBB6Q9BUF5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBB6Q9BUF5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBB6Q9BUF5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBB6Q9BUF5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBB6Q9BUF5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBB6Q9BUF5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBB6Q9BUF5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBB6Q9BUF5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBB6Q9BUF5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBB6Q9BUF5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBB6Q9BUF5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBB6Q9BUF5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBB6Q9BUF5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBB6Q9BUF5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBB6Q9BUF5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBB6Q9BUF5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBB6Q9BUF5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBB6Q9BUF5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB6Q9BUF5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB6Q9BUF5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB6Q9BUF5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB6Q9BUF5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB6Q9BUF5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB6Q9BUF5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB6Q9BUF5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB6Q9BUF5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB6Q9BUF5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB6Q9BUF5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB6Q9BUF5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB6Q9BUF5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBB6Q9BUF5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBB6Q9BUF5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBB6Q9BUF5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBB6Q9BUF5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBB6Q9BUF5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBB6Q9BUF5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBB6Q9BUF5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBB6Q9BUF5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBB6Q9BUF5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBB6Q9BUF5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBB6Q9BUF5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBB6Q9BUF5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBB6Q9BUF5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBB6Q9BUF5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
TUBB6Q9BUF5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBB6Q9BUF5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBB6Q9BUF5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBB6Q9BUF5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBB6Q9BUF5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBB6Q9BUF5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBB6Q9BUF5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBB6Q9BUF5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBB6Q9BUF5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBB6Q9BUF5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBB6Q9BUF5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBB6Q9BUF5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBB6Q9BUF5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBB6Q9BUF5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms