Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDC1Q9BTX1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDC1Q9BTX1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDC1Q9BTX1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDC1Q9BTX1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDC1Q9BTX1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDC1Q9BTX1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDC1Q9BTX1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDC1Q9BTX1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NDC1Q9BTX1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDC1Q9BTX1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDC1Q9BTX1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NDC1Q9BTX1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDC1Q9BTX1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDC1Q9BTX1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDC1Q9BTX1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDC1Q9BTX1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDC1Q9BTX1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDC1Q9BTX1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NDC1Q9BTX1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDC1Q9BTX1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDC1Q9BTX1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NDC1Q9BTX1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDC1Q9BTX1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDC1Q9BTX1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDC1Q9BTX1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDC1Q9BTX1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDC1Q9BTX1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDC1Q9BTX1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDC1Q9BTX1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDC1Q9BTX1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDC1Q9BTX1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDC1Q9BTX1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDC1Q9BTX1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDC1Q9BTX1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDC1Q9BTX1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDC1Q9BTX1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDC1Q9BTX1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDC1Q9BTX1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDC1Q9BTX1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDC1Q9BTX1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDC1Q9BTX1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDC1Q9BTX1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDC1Q9BTX1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDC1Q9BTX1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDC1Q9BTX1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDC1Q9BTX1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDC1Q9BTX1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDC1Q9BTX1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDC1Q9BTX1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDC1Q9BTX1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDC1Q9BTX1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDC1Q9BTX1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDC1Q9BTX1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDC1Q9BTX1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
NDC1Q9BTX1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDC1Q9BTX1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDC1Q9BTX1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NDC1Q9BTX1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDC1Q9BTX1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDC1Q9BTX1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDC1Q9BTX1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDC1Q9BTX1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDC1Q9BTX1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDC1Q9BTX1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDC1Q9BTX1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDC1Q9BTX1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDC1Q9BTX1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NDC1Q9BTX1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NDC1Q9BTX1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDC1Q9BTX1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDC1Q9BTX1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDC1Q9BTX1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDC1Q9BTX1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDC1Q9BTX1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDC1Q9BTX1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDC1Q9BTX1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NDC1Q9BTX1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDC1Q9BTX1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDC1Q9BTX1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDC1Q9BTX1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDC1Q9BTX1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDC1Q9BTX1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDC1Q9BTX1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDC1Q9BTX1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDC1Q9BTX1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDC1Q9BTX1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDC1Q9BTX1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDC1Q9BTX1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDC1Q9BTX1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDC1Q9BTX1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDC1Q9BTX1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDC1Q9BTX1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDC1Q9BTX1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NDC1Q9BTX1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDC1Q9BTX1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDC1Q9BTX1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDC1Q9BTX1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NDC1Q9BTX1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NDC1Q9BTX1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms