Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM43Q9BTV4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM43Q9BTV4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM43Q9BTV4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM43Q9BTV4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM43Q9BTV4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM43Q9BTV4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM43Q9BTV4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM43Q9BTV4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM43Q9BTV4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM43Q9BTV4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM43Q9BTV4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM43Q9BTV4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM43Q9BTV4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM43Q9BTV4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM43Q9BTV4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM43Q9BTV4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM43Q9BTV4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM43Q9BTV4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM43Q9BTV4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM43Q9BTV4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM43Q9BTV4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM43Q9BTV4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM43Q9BTV4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM43Q9BTV4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM43Q9BTV4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM43Q9BTV4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM43Q9BTV4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM43Q9BTV4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM43Q9BTV4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM43Q9BTV4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM43Q9BTV4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM43Q9BTV4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM43Q9BTV4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM43Q9BTV4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM43Q9BTV4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM43Q9BTV4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM43Q9BTV4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM43Q9BTV4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM43Q9BTV4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM43Q9BTV4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM43Q9BTV4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM43Q9BTV4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM43Q9BTV4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM43Q9BTV4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM43Q9BTV4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM43Q9BTV4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM43Q9BTV4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM43Q9BTV4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM43Q9BTV4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM43Q9BTV4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM43Q9BTV4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM43Q9BTV4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM43Q9BTV4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM43Q9BTV4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM43Q9BTV4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM43Q9BTV4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM43Q9BTV4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM43Q9BTV4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM43Q9BTV4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM43Q9BTV4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM43Q9BTV4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM43Q9BTV4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM43Q9BTV4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM43Q9BTV4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM43Q9BTV4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM43Q9BTV4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM43Q9BTV4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM43Q9BTV4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM43Q9BTV4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM43Q9BTV4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM43Q9BTV4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM43Q9BTV4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM43Q9BTV4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM43Q9BTV4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM43Q9BTV4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM43Q9BTV4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM43Q9BTV4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM43Q9BTV4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM43Q9BTV4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM43Q9BTV4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM43Q9BTV4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM43Q9BTV4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM43Q9BTV4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM43Q9BTV4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMEM43Q9BTV4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMEM43Q9BTV4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMEM43Q9BTV4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
TMEM43Q9BTV4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM43Q9BTV4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM43Q9BTV4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM43Q9BTV4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM43Q9BTV4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM43Q9BTV4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM43Q9BTV4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM43Q9BTV4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM43Q9BTV4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM43Q9BTV4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM43Q9BTV4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM43Q9BTV4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms