Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C2orf88Q9BSF0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C2orf88Q9BSF0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
C2orf88Q9BSF0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
C2orf88Q9BSF0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C2orf88Q9BSF0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C2orf88Q9BSF0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
C2orf88Q9BSF0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C2orf88Q9BSF0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C2orf88Q9BSF0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C2orf88Q9BSF0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C2orf88Q9BSF0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C2orf88Q9BSF0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
C2orf88Q9BSF0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C2orf88Q9BSF0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C2orf88Q9BSF0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C2orf88Q9BSF0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C2orf88Q9BSF0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C2orf88Q9BSF0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C2orf88Q9BSF0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C2orf88Q9BSF0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C2orf88Q9BSF0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C2orf88Q9BSF0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C2orf88Q9BSF0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C2orf88Q9BSF0 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C2orf88Q9BSF0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C2orf88Q9BSF0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C2orf88Q9BSF0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C2orf88Q9BSF0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C2orf88Q9BSF0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C2orf88Q9BSF0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C2orf88Q9BSF0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C2orf88Q9BSF0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C2orf88Q9BSF0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
C2orf88Q9BSF0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C2orf88Q9BSF0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C2orf88Q9BSF0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C2orf88Q9BSF0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C2orf88Q9BSF0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C2orf88Q9BSF0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C2orf88Q9BSF0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C2orf88Q9BSF0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C2orf88Q9BSF0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C2orf88Q9BSF0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C2orf88Q9BSF0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C2orf88Q9BSF0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C2orf88Q9BSF0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
C2orf88Q9BSF0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C2orf88Q9BSF0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C2orf88Q9BSF0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
C2orf88Q9BSF0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C2orf88Q9BSF0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C2orf88Q9BSF0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C2orf88Q9BSF0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C2orf88Q9BSF0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C2orf88Q9BSF0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C2orf88Q9BSF0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C2orf88Q9BSF0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C2orf88Q9BSF0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C2orf88Q9BSF0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C2orf88Q9BSF0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C2orf88Q9BSF0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C2orf88Q9BSF0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
C2orf88Q9BSF0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
C2orf88Q9BSF0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C2orf88Q9BSF0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C2orf88Q9BSF0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C2orf88Q9BSF0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C2orf88Q9BSF0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C2orf88Q9BSF0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C2orf88Q9BSF0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C2orf88Q9BSF0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C2orf88Q9BSF0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C2orf88Q9BSF0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C2orf88Q9BSF0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C2orf88Q9BSF0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C2orf88Q9BSF0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C2orf88Q9BSF0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C2orf88Q9BSF0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C2orf88Q9BSF0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C2orf88Q9BSF0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C2orf88Q9BSF0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C2orf88Q9BSF0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C2orf88Q9BSF0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C2orf88Q9BSF0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C2orf88Q9BSF0 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C2orf88Q9BSF0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C2orf88Q9BSF0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C2orf88Q9BSF0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C2orf88Q9BSF0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C2orf88Q9BSF0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C2orf88Q9BSF0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C2orf88Q9BSF0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C2orf88Q9BSF0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C2orf88Q9BSF0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C2orf88Q9BSF0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C2orf88Q9BSF0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C2orf88Q9BSF0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C2orf88Q9BSF0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C2orf88Q9BSF0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms