Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPOCK3Q9BQ16 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPOCK3Q9BQ16 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SPOCK3Q9BQ16 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPOCK3Q9BQ16 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPOCK3Q9BQ16 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SPOCK3Q9BQ16 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPOCK3Q9BQ16 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPOCK3Q9BQ16 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPOCK3Q9BQ16 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPOCK3Q9BQ16 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPOCK3Q9BQ16 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPOCK3Q9BQ16 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPOCK3Q9BQ16 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPOCK3Q9BQ16 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPOCK3Q9BQ16 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPOCK3Q9BQ16 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPOCK3Q9BQ16 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPOCK3Q9BQ16 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPOCK3Q9BQ16 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPOCK3Q9BQ16 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPOCK3Q9BQ16 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPOCK3Q9BQ16 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPOCK3Q9BQ16 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPOCK3Q9BQ16 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPOCK3Q9BQ16 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPOCK3Q9BQ16 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPOCK3Q9BQ16 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPOCK3Q9BQ16 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPOCK3Q9BQ16 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPOCK3Q9BQ16 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPOCK3Q9BQ16 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPOCK3Q9BQ16 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPOCK3Q9BQ16 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPOCK3Q9BQ16 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPOCK3Q9BQ16 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPOCK3Q9BQ16 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPOCK3Q9BQ16 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPOCK3Q9BQ16 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPOCK3Q9BQ16 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPOCK3Q9BQ16 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPOCK3Q9BQ16 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPOCK3Q9BQ16 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPOCK3Q9BQ16 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPOCK3Q9BQ16 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPOCK3Q9BQ16 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPOCK3Q9BQ16 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPOCK3Q9BQ16 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPOCK3Q9BQ16 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPOCK3Q9BQ16 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPOCK3Q9BQ16 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPOCK3Q9BQ16 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPOCK3Q9BQ16 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPOCK3Q9BQ16 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPOCK3Q9BQ16 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPOCK3Q9BQ16 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SPOCK3Q9BQ16 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPOCK3Q9BQ16 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPOCK3Q9BQ16 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPOCK3Q9BQ16 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPOCK3Q9BQ16 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPOCK3Q9BQ16 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPOCK3Q9BQ16 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SPOCK3Q9BQ16 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPOCK3Q9BQ16 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPOCK3Q9BQ16 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPOCK3Q9BQ16 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPOCK3Q9BQ16 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPOCK3Q9BQ16 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPOCK3Q9BQ16 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPOCK3Q9BQ16 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPOCK3Q9BQ16 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPOCK3Q9BQ16 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPOCK3Q9BQ16 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPOCK3Q9BQ16 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPOCK3Q9BQ16 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPOCK3Q9BQ16 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPOCK3Q9BQ16 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPOCK3Q9BQ16 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPOCK3Q9BQ16 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPOCK3Q9BQ16 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPOCK3Q9BQ16 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPOCK3Q9BQ16 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SPOCK3Q9BQ16 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPOCK3Q9BQ16 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPOCK3Q9BQ16 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPOCK3Q9BQ16 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPOCK3Q9BQ16 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPOCK3Q9BQ16 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPOCK3Q9BQ16 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPOCK3Q9BQ16 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPOCK3Q9BQ16 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPOCK3Q9BQ16 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPOCK3Q9BQ16 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPOCK3Q9BQ16 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SPOCK3Q9BQ16 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPOCK3Q9BQ16 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPOCK3Q9BQ16 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPOCK3Q9BQ16 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPOCK3Q9BQ16 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
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