Protein–RNA interactions for Protein: Q99941

ATF6B, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6BQ99941 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATF6BQ99941 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATF6BQ99941 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATF6BQ99941 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATF6BQ99941 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATF6BQ99941 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATF6BQ99941 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATF6BQ99941 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATF6BQ99941 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATF6BQ99941 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATF6BQ99941 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATF6BQ99941 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATF6BQ99941 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATF6BQ99941 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATF6BQ99941 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATF6BQ99941 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATF6BQ99941 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATF6BQ99941 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATF6BQ99941 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATF6BQ99941 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATF6BQ99941 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATF6BQ99941 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATF6BQ99941 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATF6BQ99941 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATF6BQ99941 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATF6BQ99941 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATF6BQ99941 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ATF6BQ99941 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATF6BQ99941 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATF6BQ99941 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATF6BQ99941 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATF6BQ99941 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ATF6BQ99941 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATF6BQ99941 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATF6BQ99941 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATF6BQ99941 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATF6BQ99941 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATF6BQ99941 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATF6BQ99941 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATF6BQ99941 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATF6BQ99941 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATF6BQ99941 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATF6BQ99941 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATF6BQ99941 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATF6BQ99941 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATF6BQ99941 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATF6BQ99941 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATF6BQ99941 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATF6BQ99941 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATF6BQ99941 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATF6BQ99941 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATF6BQ99941 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATF6BQ99941 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATF6BQ99941 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATF6BQ99941 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATF6BQ99941 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATF6BQ99941 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATF6BQ99941 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATF6BQ99941 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATF6BQ99941 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ATF6BQ99941 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATF6BQ99941 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATF6BQ99941 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATF6BQ99941 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATF6BQ99941 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATF6BQ99941 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATF6BQ99941 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATF6BQ99941 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATF6BQ99941 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATF6BQ99941 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATF6BQ99941 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATF6BQ99941 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATF6BQ99941 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATF6BQ99941 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATF6BQ99941 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATF6BQ99941 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATF6BQ99941 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATF6BQ99941 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATF6BQ99941 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATF6BQ99941 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATF6BQ99941 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATF6BQ99941 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATF6BQ99941 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATF6BQ99941 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATF6BQ99941 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATF6BQ99941 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATF6BQ99941 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATF6BQ99941 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ATF6BQ99941 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATF6BQ99941 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATF6BQ99941 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATF6BQ99941 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATF6BQ99941 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATF6BQ99941 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATF6BQ99941 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATF6BQ99941 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATF6BQ99941 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATF6BQ99941 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATF6BQ99941 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATF6BQ99941 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms