Protein–RNA interactions for Protein: Q99732

LITAF, Lipopolysaccharide-induced tumor necrosis factor-alpha factor, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LITAFQ99732 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LITAFQ99732 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LITAFQ99732 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LITAFQ99732 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LITAFQ99732 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LITAFQ99732 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LITAFQ99732 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LITAFQ99732 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LITAFQ99732 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LITAFQ99732 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LITAFQ99732 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LITAFQ99732 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LITAFQ99732 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LITAFQ99732 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LITAFQ99732 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LITAFQ99732 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LITAFQ99732 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LITAFQ99732 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LITAFQ99732 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LITAFQ99732 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LITAFQ99732 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LITAFQ99732 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LITAFQ99732 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LITAFQ99732 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LITAFQ99732 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LITAFQ99732 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LITAFQ99732 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LITAFQ99732 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LITAFQ99732 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LITAFQ99732 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LITAFQ99732 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LITAFQ99732 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LITAFQ99732 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LITAFQ99732 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LITAFQ99732 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LITAFQ99732 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LITAFQ99732 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LITAFQ99732 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LITAFQ99732 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LITAFQ99732 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LITAFQ99732 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LITAFQ99732 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LITAFQ99732 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LITAFQ99732 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LITAFQ99732 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LITAFQ99732 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LITAFQ99732 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LITAFQ99732 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LITAFQ99732 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LITAFQ99732 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LITAFQ99732 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LITAFQ99732 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LITAFQ99732 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LITAFQ99732 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LITAFQ99732 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LITAFQ99732 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LITAFQ99732 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LITAFQ99732 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LITAFQ99732 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LITAFQ99732 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LITAFQ99732 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LITAFQ99732 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LITAFQ99732 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LITAFQ99732 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LITAFQ99732 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LITAFQ99732 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LITAFQ99732 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LITAFQ99732 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LITAFQ99732 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LITAFQ99732 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LITAFQ99732 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LITAFQ99732 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LITAFQ99732 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LITAFQ99732 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LITAFQ99732 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LITAFQ99732 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LITAFQ99732 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LITAFQ99732 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LITAFQ99732 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LITAFQ99732 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LITAFQ99732 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LITAFQ99732 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LITAFQ99732 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LITAFQ99732 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LITAFQ99732 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LITAFQ99732 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LITAFQ99732 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LITAFQ99732 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LITAFQ99732 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LITAFQ99732 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LITAFQ99732 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LITAFQ99732 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LITAFQ99732 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LITAFQ99732 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LITAFQ99732 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LITAFQ99732 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LITAFQ99732 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LITAFQ99732 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LITAFQ99732 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LITAFQ99732 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms