Protein–RNA interactions for Protein: Q99720

SIGMAR1, Sigma non-opioid intracellular receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGMAR1Q99720 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIGMAR1Q99720 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIGMAR1Q99720 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIGMAR1Q99720 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIGMAR1Q99720 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIGMAR1Q99720 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIGMAR1Q99720 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIGMAR1Q99720 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIGMAR1Q99720 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIGMAR1Q99720 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIGMAR1Q99720 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIGMAR1Q99720 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIGMAR1Q99720 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIGMAR1Q99720 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIGMAR1Q99720 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIGMAR1Q99720 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIGMAR1Q99720 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIGMAR1Q99720 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms