Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
MEIS3Q99687 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
MEIS3Q99687 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
MEIS3Q99687 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
MEIS3Q99687 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
MEIS3Q99687 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
MEIS3Q99687 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
MEIS3Q99687 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
MEIS3Q99687 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
MEIS3Q99687 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
MEIS3Q99687 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
MEIS3Q99687 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
MEIS3Q99687 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
MEIS3Q99687 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
MEIS3Q99687 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
MEIS3Q99687 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
MEIS3Q99687 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
MEIS3Q99687 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
MEIS3Q99687 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
MEIS3Q99687 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
MEIS3Q99687 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
MEIS3Q99687 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
MEIS3Q99687 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
MEIS3Q99687 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
MEIS3Q99687 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
MEIS3Q99687 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MEIS3Q99687 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MEIS3Q99687 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
MEIS3Q99687 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
MEIS3Q99687 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
MEIS3Q99687 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
MEIS3Q99687 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
MEIS3Q99687 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
MEIS3Q99687 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
MEIS3Q99687 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MEIS3Q99687 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
MEIS3Q99687 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MEIS3Q99687 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MEIS3Q99687 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MEIS3Q99687 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
MEIS3Q99687 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
MEIS3Q99687 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
MEIS3Q99687 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MEIS3Q99687 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MEIS3Q99687 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MEIS3Q99687 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
MEIS3Q99687 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
MEIS3Q99687 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
MEIS3Q99687 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
MEIS3Q99687 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
MEIS3Q99687 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
MEIS3Q99687 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
MEIS3Q99687 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
MEIS3Q99687 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
MEIS3Q99687 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
MEIS3Q99687 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
MEIS3Q99687 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
MEIS3Q99687 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
MEIS3Q99687 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
MEIS3Q99687 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
MEIS3Q99687 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
MEIS3Q99687 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
MEIS3Q99687 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
MEIS3Q99687 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
MEIS3Q99687 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
MEIS3Q99687 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
MEIS3Q99687 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
MEIS3Q99687 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
MEIS3Q99687 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
MEIS3Q99687 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
MEIS3Q99687 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
MEIS3Q99687 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
MEIS3Q99687 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
MEIS3Q99687 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
MEIS3Q99687 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
MEIS3Q99687 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
MEIS3Q99687 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
MEIS3Q99687 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
MEIS3Q99687 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MEIS3Q99687 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MEIS3Q99687 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MEIS3Q99687 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MEIS3Q99687 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MEIS3Q99687 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
MEIS3Q99687 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
MEIS3Q99687 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MEIS3Q99687 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
MEIS3Q99687 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
MEIS3Q99687 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
MEIS3Q99687 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
MEIS3Q99687 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
MEIS3Q99687 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
MEIS3Q99687 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
MEIS3Q99687 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
MEIS3Q99687 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
MEIS3Q99687 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
MEIS3Q99687 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
MEIS3Q99687 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MEIS3Q99687 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MEIS3Q99687 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms