Protein–RNA interactions for Protein: Q99674

CGREF1, Cell growth regulator with EF hand domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGREF1Q99674 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CGREF1Q99674 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CGREF1Q99674 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CGREF1Q99674 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CGREF1Q99674 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CGREF1Q99674 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CGREF1Q99674 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CGREF1Q99674 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CGREF1Q99674 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CGREF1Q99674 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CGREF1Q99674 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CGREF1Q99674 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CGREF1Q99674 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CGREF1Q99674 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CGREF1Q99674 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CGREF1Q99674 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CGREF1Q99674 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CGREF1Q99674 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CGREF1Q99674 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CGREF1Q99674 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CGREF1Q99674 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CGREF1Q99674 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CGREF1Q99674 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CGREF1Q99674 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CGREF1Q99674 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CGREF1Q99674 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CGREF1Q99674 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CGREF1Q99674 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CGREF1Q99674 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CGREF1Q99674 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CGREF1Q99674 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CGREF1Q99674 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CGREF1Q99674 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CGREF1Q99674 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CGREF1Q99674 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CGREF1Q99674 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CGREF1Q99674 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CGREF1Q99674 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CGREF1Q99674 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CGREF1Q99674 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CGREF1Q99674 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CGREF1Q99674 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CGREF1Q99674 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CGREF1Q99674 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CGREF1Q99674 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CGREF1Q99674 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CGREF1Q99674 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CGREF1Q99674 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CGREF1Q99674 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CGREF1Q99674 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CGREF1Q99674 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CGREF1Q99674 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CGREF1Q99674 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CGREF1Q99674 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CGREF1Q99674 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CGREF1Q99674 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CGREF1Q99674 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CGREF1Q99674 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CGREF1Q99674 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CGREF1Q99674 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CGREF1Q99674 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CGREF1Q99674 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CGREF1Q99674 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CGREF1Q99674 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CGREF1Q99674 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CGREF1Q99674 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CGREF1Q99674 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CGREF1Q99674 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CGREF1Q99674 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CGREF1Q99674 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CGREF1Q99674 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CGREF1Q99674 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CGREF1Q99674 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CGREF1Q99674 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CGREF1Q99674 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CGREF1Q99674 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CGREF1Q99674 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CGREF1Q99674 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CGREF1Q99674 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CGREF1Q99674 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CGREF1Q99674 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CGREF1Q99674 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CGREF1Q99674 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CGREF1Q99674 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CGREF1Q99674 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CGREF1Q99674 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CGREF1Q99674 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CGREF1Q99674 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CGREF1Q99674 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CGREF1Q99674 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CGREF1Q99674 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CGREF1Q99674 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CGREF1Q99674 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CGREF1Q99674 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CGREF1Q99674 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CGREF1Q99674 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CGREF1Q99674 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CGREF1Q99674 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CGREF1Q99674 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CGREF1Q99674 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms