Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
VAT1Q99536 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VAT1Q99536 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VAT1Q99536 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VAT1Q99536 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VAT1Q99536 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VAT1Q99536 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VAT1Q99536 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
VAT1Q99536 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VAT1Q99536 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VAT1Q99536 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VAT1Q99536 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VAT1Q99536 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
VAT1Q99536 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
VAT1Q99536 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VAT1Q99536 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VAT1Q99536 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VAT1Q99536 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VAT1Q99536 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VAT1Q99536 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VAT1Q99536 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VAT1Q99536 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VAT1Q99536 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VAT1Q99536 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VAT1Q99536 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VAT1Q99536 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VAT1Q99536 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VAT1Q99536 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VAT1Q99536 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VAT1Q99536 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VAT1Q99536 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VAT1Q99536 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VAT1Q99536 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VAT1Q99536 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VAT1Q99536 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VAT1Q99536 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VAT1Q99536 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VAT1Q99536 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
VAT1Q99536 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VAT1Q99536 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VAT1Q99536 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VAT1Q99536 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VAT1Q99536 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VAT1Q99536 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VAT1Q99536 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VAT1Q99536 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VAT1Q99536 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VAT1Q99536 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VAT1Q99536 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VAT1Q99536 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VAT1Q99536 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VAT1Q99536 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VAT1Q99536 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VAT1Q99536 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VAT1Q99536 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAT1Q99536 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAT1Q99536 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAT1Q99536 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAT1Q99536 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAT1Q99536 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAT1Q99536 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAT1Q99536 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VAT1Q99536 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VAT1Q99536 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VAT1Q99536 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VAT1Q99536 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAT1Q99536 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAT1Q99536 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAT1Q99536 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAT1Q99536 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
VAT1Q99536 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAT1Q99536 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAT1Q99536 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAT1Q99536 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAT1Q99536 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAT1Q99536 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAT1Q99536 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VAT1Q99536 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VAT1Q99536 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VAT1Q99536 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VAT1Q99536 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VAT1Q99536 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VAT1Q99536 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VAT1Q99536 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VAT1Q99536 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VAT1Q99536 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAT1Q99536 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAT1Q99536 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAT1Q99536 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAT1Q99536 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAT1Q99536 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAT1Q99536 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAT1Q99536 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAT1Q99536 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAT1Q99536 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAT1Q99536 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAT1Q99536 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAT1Q99536 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VAT1Q99536 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAT1Q99536 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms