Protein–RNA interactions for Protein: Q96T66

NMNAT3, Nicotinamide/nicotinic acid mononucleotide adenylyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMNAT3Q96T66 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NMNAT3Q96T66 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NMNAT3Q96T66 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NMNAT3Q96T66 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NMNAT3Q96T66 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NMNAT3Q96T66 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NMNAT3Q96T66 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NMNAT3Q96T66 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NMNAT3Q96T66 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NMNAT3Q96T66 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NMNAT3Q96T66 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NMNAT3Q96T66 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NMNAT3Q96T66 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NMNAT3Q96T66 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NMNAT3Q96T66 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NMNAT3Q96T66 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NMNAT3Q96T66 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NMNAT3Q96T66 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NMNAT3Q96T66 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NMNAT3Q96T66 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NMNAT3Q96T66 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NMNAT3Q96T66 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NMNAT3Q96T66 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NMNAT3Q96T66 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NMNAT3Q96T66 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NMNAT3Q96T66 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NMNAT3Q96T66 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NMNAT3Q96T66 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NMNAT3Q96T66 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NMNAT3Q96T66 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NMNAT3Q96T66 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NMNAT3Q96T66 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NMNAT3Q96T66 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NMNAT3Q96T66 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NMNAT3Q96T66 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NMNAT3Q96T66 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NMNAT3Q96T66 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NMNAT3Q96T66 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NMNAT3Q96T66 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NMNAT3Q96T66 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NMNAT3Q96T66 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NMNAT3Q96T66 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NMNAT3Q96T66 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NMNAT3Q96T66 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NMNAT3Q96T66 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NMNAT3Q96T66 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NMNAT3Q96T66 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
NMNAT3Q96T66 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NMNAT3Q96T66 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NMNAT3Q96T66 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NMNAT3Q96T66 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NMNAT3Q96T66 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NMNAT3Q96T66 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NMNAT3Q96T66 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NMNAT3Q96T66 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NMNAT3Q96T66 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NMNAT3Q96T66 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NMNAT3Q96T66 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NMNAT3Q96T66 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NMNAT3Q96T66 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
NMNAT3Q96T66 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NMNAT3Q96T66 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NMNAT3Q96T66 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NMNAT3Q96T66 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NMNAT3Q96T66 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NMNAT3Q96T66 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NMNAT3Q96T66 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NMNAT3Q96T66 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NMNAT3Q96T66 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NMNAT3Q96T66 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NMNAT3Q96T66 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NMNAT3Q96T66 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NMNAT3Q96T66 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NMNAT3Q96T66 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NMNAT3Q96T66 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NMNAT3Q96T66 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NMNAT3Q96T66 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NMNAT3Q96T66 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NMNAT3Q96T66 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NMNAT3Q96T66 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NMNAT3Q96T66 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NMNAT3Q96T66 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NMNAT3Q96T66 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NMNAT3Q96T66 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NMNAT3Q96T66 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NMNAT3Q96T66 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NMNAT3Q96T66 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NMNAT3Q96T66 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NMNAT3Q96T66 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NMNAT3Q96T66 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NMNAT3Q96T66 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NMNAT3Q96T66 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NMNAT3Q96T66 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NMNAT3Q96T66 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NMNAT3Q96T66 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NMNAT3Q96T66 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NMNAT3Q96T66 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NMNAT3Q96T66 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NMNAT3Q96T66 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NMNAT3Q96T66 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms