Protein–RNA interactions for Protein: Q96SM3

CPXM1, Probable carboxypeptidase X1, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPXM1Q96SM3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPXM1Q96SM3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPXM1Q96SM3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPXM1Q96SM3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CPXM1Q96SM3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPXM1Q96SM3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CPXM1Q96SM3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPXM1Q96SM3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPXM1Q96SM3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPXM1Q96SM3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPXM1Q96SM3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPXM1Q96SM3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPXM1Q96SM3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPXM1Q96SM3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CPXM1Q96SM3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CPXM1Q96SM3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPXM1Q96SM3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPXM1Q96SM3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPXM1Q96SM3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPXM1Q96SM3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPXM1Q96SM3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPXM1Q96SM3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPXM1Q96SM3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPXM1Q96SM3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPXM1Q96SM3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPXM1Q96SM3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPXM1Q96SM3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPXM1Q96SM3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPXM1Q96SM3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPXM1Q96SM3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPXM1Q96SM3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CPXM1Q96SM3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPXM1Q96SM3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPXM1Q96SM3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CPXM1Q96SM3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CPXM1Q96SM3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CPXM1Q96SM3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CPXM1Q96SM3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPXM1Q96SM3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPXM1Q96SM3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CPXM1Q96SM3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CPXM1Q96SM3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CPXM1Q96SM3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CPXM1Q96SM3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CPXM1Q96SM3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CPXM1Q96SM3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CPXM1Q96SM3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CPXM1Q96SM3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CPXM1Q96SM3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CPXM1Q96SM3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CPXM1Q96SM3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CPXM1Q96SM3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CPXM1Q96SM3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CPXM1Q96SM3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CPXM1Q96SM3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CPXM1Q96SM3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CPXM1Q96SM3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CPXM1Q96SM3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CPXM1Q96SM3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CPXM1Q96SM3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CPXM1Q96SM3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CPXM1Q96SM3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CPXM1Q96SM3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CPXM1Q96SM3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CPXM1Q96SM3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CPXM1Q96SM3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CPXM1Q96SM3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CPXM1Q96SM3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CPXM1Q96SM3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CPXM1Q96SM3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CPXM1Q96SM3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CPXM1Q96SM3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CPXM1Q96SM3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CPXM1Q96SM3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CPXM1Q96SM3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CPXM1Q96SM3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CPXM1Q96SM3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CPXM1Q96SM3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CPXM1Q96SM3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CPXM1Q96SM3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CPXM1Q96SM3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CPXM1Q96SM3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CPXM1Q96SM3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CPXM1Q96SM3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CPXM1Q96SM3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CPXM1Q96SM3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CPXM1Q96SM3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CPXM1Q96SM3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CPXM1Q96SM3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CPXM1Q96SM3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CPXM1Q96SM3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CPXM1Q96SM3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CPXM1Q96SM3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CPXM1Q96SM3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CPXM1Q96SM3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CPXM1Q96SM3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CPXM1Q96SM3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CPXM1Q96SM3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CPXM1Q96SM3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CPXM1Q96SM3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms