Protein–RNA interactions for Protein: Q96S42

NODAL, Nodal homolog, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NODALQ96S42 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NODALQ96S42 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NODALQ96S42 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NODALQ96S42 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NODALQ96S42 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NODALQ96S42 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NODALQ96S42 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NODALQ96S42 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NODALQ96S42 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NODALQ96S42 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NODALQ96S42 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NODALQ96S42 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NODALQ96S42 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NODALQ96S42 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NODALQ96S42 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NODALQ96S42 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NODALQ96S42 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NODALQ96S42 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NODALQ96S42 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NODALQ96S42 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NODALQ96S42 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NODALQ96S42 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NODALQ96S42 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NODALQ96S42 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NODALQ96S42 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NODALQ96S42 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NODALQ96S42 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NODALQ96S42 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NODALQ96S42 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NODALQ96S42 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NODALQ96S42 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NODALQ96S42 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NODALQ96S42 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NODALQ96S42 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NODALQ96S42 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NODALQ96S42 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NODALQ96S42 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NODALQ96S42 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NODALQ96S42 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NODALQ96S42 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NODALQ96S42 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NODALQ96S42 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NODALQ96S42 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NODALQ96S42 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NODALQ96S42 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NODALQ96S42 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NODALQ96S42 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NODALQ96S42 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NODALQ96S42 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NODALQ96S42 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NODALQ96S42 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NODALQ96S42 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NODALQ96S42 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NODALQ96S42 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NODALQ96S42 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NODALQ96S42 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NODALQ96S42 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NODALQ96S42 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NODALQ96S42 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NODALQ96S42 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NODALQ96S42 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NODALQ96S42 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NODALQ96S42 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NODALQ96S42 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NODALQ96S42 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NODALQ96S42 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NODALQ96S42 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NODALQ96S42 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NODALQ96S42 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NODALQ96S42 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NODALQ96S42 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NODALQ96S42 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NODALQ96S42 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NODALQ96S42 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NODALQ96S42 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NODALQ96S42 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NODALQ96S42 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NODALQ96S42 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NODALQ96S42 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NODALQ96S42 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NODALQ96S42 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NODALQ96S42 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NODALQ96S42 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NODALQ96S42 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NODALQ96S42 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NODALQ96S42 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NODALQ96S42 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NODALQ96S42 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NODALQ96S42 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NODALQ96S42 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NODALQ96S42 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NODALQ96S42 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NODALQ96S42 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NODALQ96S42 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NODALQ96S42 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NODALQ96S42 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NODALQ96S42 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NODALQ96S42 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NODALQ96S42 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NODALQ96S42 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms