Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB3IPQ96QF0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB3IPQ96QF0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB3IPQ96QF0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB3IPQ96QF0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB3IPQ96QF0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB3IPQ96QF0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB3IPQ96QF0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB3IPQ96QF0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB3IPQ96QF0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB3IPQ96QF0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB3IPQ96QF0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB3IPQ96QF0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB3IPQ96QF0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB3IPQ96QF0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB3IPQ96QF0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB3IPQ96QF0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB3IPQ96QF0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB3IPQ96QF0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB3IPQ96QF0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB3IPQ96QF0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB3IPQ96QF0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB3IPQ96QF0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB3IPQ96QF0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB3IPQ96QF0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB3IPQ96QF0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB3IPQ96QF0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB3IPQ96QF0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB3IPQ96QF0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB3IPQ96QF0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB3IPQ96QF0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB3IPQ96QF0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB3IPQ96QF0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB3IPQ96QF0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB3IPQ96QF0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB3IPQ96QF0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB3IPQ96QF0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB3IPQ96QF0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB3IPQ96QF0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB3IPQ96QF0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB3IPQ96QF0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB3IPQ96QF0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB3IPQ96QF0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB3IPQ96QF0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB3IPQ96QF0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB3IPQ96QF0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB3IPQ96QF0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB3IPQ96QF0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB3IPQ96QF0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB3IPQ96QF0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB3IPQ96QF0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB3IPQ96QF0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB3IPQ96QF0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB3IPQ96QF0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB3IPQ96QF0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAB3IPQ96QF0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAB3IPQ96QF0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB3IPQ96QF0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB3IPQ96QF0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB3IPQ96QF0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB3IPQ96QF0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB3IPQ96QF0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB3IPQ96QF0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB3IPQ96QF0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB3IPQ96QF0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB3IPQ96QF0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB3IPQ96QF0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB3IPQ96QF0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB3IPQ96QF0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB3IPQ96QF0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB3IPQ96QF0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB3IPQ96QF0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB3IPQ96QF0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB3IPQ96QF0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB3IPQ96QF0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB3IPQ96QF0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB3IPQ96QF0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB3IPQ96QF0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB3IPQ96QF0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB3IPQ96QF0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB3IPQ96QF0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB3IPQ96QF0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB3IPQ96QF0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB3IPQ96QF0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB3IPQ96QF0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB3IPQ96QF0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB3IPQ96QF0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB3IPQ96QF0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB3IPQ96QF0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB3IPQ96QF0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB3IPQ96QF0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB3IPQ96QF0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB3IPQ96QF0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB3IPQ96QF0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB3IPQ96QF0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB3IPQ96QF0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB3IPQ96QF0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB3IPQ96QF0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB3IPQ96QF0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB3IPQ96QF0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms