Protein–RNA interactions for Protein: Q96N96

SPATA13, Spermatogenesis-associated protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA13Q96N96 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPATA13Q96N96 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPATA13Q96N96 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPATA13Q96N96 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPATA13Q96N96 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPATA13Q96N96 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPATA13Q96N96 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPATA13Q96N96 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPATA13Q96N96 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPATA13Q96N96 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPATA13Q96N96 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPATA13Q96N96 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPATA13Q96N96 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPATA13Q96N96 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPATA13Q96N96 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPATA13Q96N96 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SPATA13Q96N96 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPATA13Q96N96 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPATA13Q96N96 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPATA13Q96N96 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SPATA13Q96N96 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPATA13Q96N96 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPATA13Q96N96 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPATA13Q96N96 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPATA13Q96N96 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPATA13Q96N96 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPATA13Q96N96 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPATA13Q96N96 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPATA13Q96N96 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPATA13Q96N96 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPATA13Q96N96 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPATA13Q96N96 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SPATA13Q96N96 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPATA13Q96N96 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPATA13Q96N96 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPATA13Q96N96 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPATA13Q96N96 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPATA13Q96N96 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPATA13Q96N96 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPATA13Q96N96 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPATA13Q96N96 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SPATA13Q96N96 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
SPATA13Q96N96 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPATA13Q96N96 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPATA13Q96N96 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPATA13Q96N96 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPATA13Q96N96 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPATA13Q96N96 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPATA13Q96N96 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPATA13Q96N96 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPATA13Q96N96 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPATA13Q96N96 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SPATA13Q96N96 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPATA13Q96N96 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPATA13Q96N96 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPATA13Q96N96 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPATA13Q96N96 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPATA13Q96N96 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPATA13Q96N96 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPATA13Q96N96 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPATA13Q96N96 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPATA13Q96N96 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPATA13Q96N96 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPATA13Q96N96 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPATA13Q96N96 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPATA13Q96N96 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPATA13Q96N96 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPATA13Q96N96 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPATA13Q96N96 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPATA13Q96N96 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPATA13Q96N96 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPATA13Q96N96 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPATA13Q96N96 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPATA13Q96N96 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPATA13Q96N96 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPATA13Q96N96 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPATA13Q96N96 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPATA13Q96N96 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPATA13Q96N96 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPATA13Q96N96 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPATA13Q96N96 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPATA13Q96N96 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPATA13Q96N96 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPATA13Q96N96 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPATA13Q96N96 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPATA13Q96N96 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPATA13Q96N96 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPATA13Q96N96 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPATA13Q96N96 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPATA13Q96N96 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPATA13Q96N96 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPATA13Q96N96 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPATA13Q96N96 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPATA13Q96N96 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPATA13Q96N96 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPATA13Q96N96 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPATA13Q96N96 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPATA13Q96N96 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPATA13Q96N96 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPATA13Q96N96 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms