Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSMCE2Q96MF7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSMCE2Q96MF7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSMCE2Q96MF7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSMCE2Q96MF7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSMCE2Q96MF7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSMCE2Q96MF7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSMCE2Q96MF7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSMCE2Q96MF7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NSMCE2Q96MF7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSMCE2Q96MF7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSMCE2Q96MF7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSMCE2Q96MF7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSMCE2Q96MF7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSMCE2Q96MF7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSMCE2Q96MF7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSMCE2Q96MF7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSMCE2Q96MF7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSMCE2Q96MF7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSMCE2Q96MF7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSMCE2Q96MF7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NSMCE2Q96MF7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NSMCE2Q96MF7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NSMCE2Q96MF7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSMCE2Q96MF7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NSMCE2Q96MF7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NSMCE2Q96MF7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSMCE2Q96MF7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NSMCE2Q96MF7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NSMCE2Q96MF7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NSMCE2Q96MF7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NSMCE2Q96MF7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NSMCE2Q96MF7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSMCE2Q96MF7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NSMCE2Q96MF7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSMCE2Q96MF7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSMCE2Q96MF7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSMCE2Q96MF7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSMCE2Q96MF7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSMCE2Q96MF7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSMCE2Q96MF7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSMCE2Q96MF7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSMCE2Q96MF7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSMCE2Q96MF7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSMCE2Q96MF7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSMCE2Q96MF7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NSMCE2Q96MF7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NSMCE2Q96MF7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NSMCE2Q96MF7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NSMCE2Q96MF7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NSMCE2Q96MF7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NSMCE2Q96MF7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NSMCE2Q96MF7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NSMCE2Q96MF7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NSMCE2Q96MF7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSMCE2Q96MF7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSMCE2Q96MF7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSMCE2Q96MF7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSMCE2Q96MF7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSMCE2Q96MF7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NSMCE2Q96MF7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NSMCE2Q96MF7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NSMCE2Q96MF7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NSMCE2Q96MF7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NSMCE2Q96MF7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NSMCE2Q96MF7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NSMCE2Q96MF7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NSMCE2Q96MF7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NSMCE2Q96MF7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NSMCE2Q96MF7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NSMCE2Q96MF7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NSMCE2Q96MF7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NSMCE2Q96MF7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NSMCE2Q96MF7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSMCE2Q96MF7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.6 ms