Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC7Q96M83 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC7Q96M83 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC7Q96M83 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CCDC7Q96M83 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CCDC7Q96M83 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CCDC7Q96M83 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CCDC7Q96M83 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC7Q96M83 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC7Q96M83 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC7Q96M83 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC7Q96M83 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC7Q96M83 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC7Q96M83 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC7Q96M83 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CCDC7Q96M83 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CCDC7Q96M83 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CCDC7Q96M83 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CCDC7Q96M83 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CCDC7Q96M83 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CCDC7Q96M83 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CCDC7Q96M83 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CCDC7Q96M83 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
CCDC7Q96M83 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
CCDC7Q96M83 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CCDC7Q96M83 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CCDC7Q96M83 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CCDC7Q96M83 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CCDC7Q96M83 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CCDC7Q96M83 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CCDC7Q96M83 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CCDC7Q96M83 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CCDC7Q96M83 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CCDC7Q96M83 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CCDC7Q96M83 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CCDC7Q96M83 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CCDC7Q96M83 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CCDC7Q96M83 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CCDC7Q96M83 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CCDC7Q96M83 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
CCDC7Q96M83 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CCDC7Q96M83 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CCDC7Q96M83 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CCDC7Q96M83 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CCDC7Q96M83 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CCDC7Q96M83 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CCDC7Q96M83 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CCDC7Q96M83 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CCDC7Q96M83 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CCDC7Q96M83 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CCDC7Q96M83 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CCDC7Q96M83 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CCDC7Q96M83 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CCDC7Q96M83 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CCDC7Q96M83 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CCDC7Q96M83 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CCDC7Q96M83 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CCDC7Q96M83 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CCDC7Q96M83 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CCDC7Q96M83 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CCDC7Q96M83 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CCDC7Q96M83 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CCDC7Q96M83 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCDC7Q96M83 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCDC7Q96M83 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCDC7Q96M83 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCDC7Q96M83 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CCDC7Q96M83 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CCDC7Q96M83 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CCDC7Q96M83 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CCDC7Q96M83 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CCDC7Q96M83 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CCDC7Q96M83 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CCDC7Q96M83 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CCDC7Q96M83 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CCDC7Q96M83 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
CCDC7Q96M83 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CCDC7Q96M83 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CCDC7Q96M83 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CCDC7Q96M83 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CCDC7Q96M83 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CCDC7Q96M83 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CCDC7Q96M83 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CCDC7Q96M83 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
CCDC7Q96M83 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCDC7Q96M83 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCDC7Q96M83 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
CCDC7Q96M83 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCDC7Q96M83 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCDC7Q96M83 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCDC7Q96M83 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCDC7Q96M83 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCDC7Q96M83 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCDC7Q96M83 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCDC7Q96M83 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCDC7Q96M83 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
CCDC7Q96M83 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
CCDC7Q96M83 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CCDC7Q96M83 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
CCDC7Q96M83 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms