Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PKNOX2Q96KN3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PKNOX2Q96KN3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PKNOX2Q96KN3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PKNOX2Q96KN3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PKNOX2Q96KN3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PKNOX2Q96KN3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PKNOX2Q96KN3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PKNOX2Q96KN3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PKNOX2Q96KN3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PKNOX2Q96KN3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PKNOX2Q96KN3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PKNOX2Q96KN3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PKNOX2Q96KN3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PKNOX2Q96KN3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PKNOX2Q96KN3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PKNOX2Q96KN3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PKNOX2Q96KN3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PKNOX2Q96KN3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PKNOX2Q96KN3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PKNOX2Q96KN3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PKNOX2Q96KN3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PKNOX2Q96KN3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PKNOX2Q96KN3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PKNOX2Q96KN3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PKNOX2Q96KN3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PKNOX2Q96KN3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PKNOX2Q96KN3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PKNOX2Q96KN3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PKNOX2Q96KN3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PKNOX2Q96KN3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PKNOX2Q96KN3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PKNOX2Q96KN3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PKNOX2Q96KN3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PKNOX2Q96KN3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PKNOX2Q96KN3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PKNOX2Q96KN3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PKNOX2Q96KN3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PKNOX2Q96KN3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PKNOX2Q96KN3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PKNOX2Q96KN3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PKNOX2Q96KN3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PKNOX2Q96KN3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PKNOX2Q96KN3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PKNOX2Q96KN3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PKNOX2Q96KN3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PKNOX2Q96KN3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PKNOX2Q96KN3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PKNOX2Q96KN3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PKNOX2Q96KN3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PKNOX2Q96KN3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKNOX2Q96KN3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKNOX2Q96KN3 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKNOX2Q96KN3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKNOX2Q96KN3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKNOX2Q96KN3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKNOX2Q96KN3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKNOX2Q96KN3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKNOX2Q96KN3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PKNOX2Q96KN3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PKNOX2Q96KN3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PKNOX2Q96KN3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PKNOX2Q96KN3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PKNOX2Q96KN3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PKNOX2Q96KN3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKNOX2Q96KN3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKNOX2Q96KN3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKNOX2Q96KN3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKNOX2Q96KN3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKNOX2Q96KN3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKNOX2Q96KN3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKNOX2Q96KN3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKNOX2Q96KN3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKNOX2Q96KN3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKNOX2Q96KN3 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKNOX2Q96KN3 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKNOX2Q96KN3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKNOX2Q96KN3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKNOX2Q96KN3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKNOX2Q96KN3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKNOX2Q96KN3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PKNOX2Q96KN3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PKNOX2Q96KN3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PKNOX2Q96KN3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PKNOX2Q96KN3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKNOX2Q96KN3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKNOX2Q96KN3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKNOX2Q96KN3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKNOX2Q96KN3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKNOX2Q96KN3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKNOX2Q96KN3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKNOX2Q96KN3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKNOX2Q96KN3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKNOX2Q96KN3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKNOX2Q96KN3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKNOX2Q96KN3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKNOX2Q96KN3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKNOX2Q96KN3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKNOX2Q96KN3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKNOX2Q96KN3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms