Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD0

PDXP, Pyridoxal phosphate phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDXPQ96GD0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDXPQ96GD0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDXPQ96GD0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDXPQ96GD0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDXPQ96GD0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PDXPQ96GD0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDXPQ96GD0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDXPQ96GD0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDXPQ96GD0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDXPQ96GD0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDXPQ96GD0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDXPQ96GD0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDXPQ96GD0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDXPQ96GD0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDXPQ96GD0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDXPQ96GD0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDXPQ96GD0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDXPQ96GD0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDXPQ96GD0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDXPQ96GD0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDXPQ96GD0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDXPQ96GD0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDXPQ96GD0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDXPQ96GD0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDXPQ96GD0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDXPQ96GD0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDXPQ96GD0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDXPQ96GD0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDXPQ96GD0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDXPQ96GD0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDXPQ96GD0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDXPQ96GD0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDXPQ96GD0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDXPQ96GD0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDXPQ96GD0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDXPQ96GD0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDXPQ96GD0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDXPQ96GD0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDXPQ96GD0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDXPQ96GD0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDXPQ96GD0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDXPQ96GD0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDXPQ96GD0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDXPQ96GD0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDXPQ96GD0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDXPQ96GD0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDXPQ96GD0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDXPQ96GD0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDXPQ96GD0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDXPQ96GD0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDXPQ96GD0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDXPQ96GD0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDXPQ96GD0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDXPQ96GD0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDXPQ96GD0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDXPQ96GD0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDXPQ96GD0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDXPQ96GD0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDXPQ96GD0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDXPQ96GD0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDXPQ96GD0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDXPQ96GD0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDXPQ96GD0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDXPQ96GD0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDXPQ96GD0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDXPQ96GD0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDXPQ96GD0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDXPQ96GD0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDXPQ96GD0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDXPQ96GD0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDXPQ96GD0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDXPQ96GD0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDXPQ96GD0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDXPQ96GD0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDXPQ96GD0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDXPQ96GD0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDXPQ96GD0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDXPQ96GD0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDXPQ96GD0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDXPQ96GD0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDXPQ96GD0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDXPQ96GD0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PDXPQ96GD0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDXPQ96GD0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDXPQ96GD0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDXPQ96GD0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDXPQ96GD0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDXPQ96GD0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDXPQ96GD0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PDXPQ96GD0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDXPQ96GD0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDXPQ96GD0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDXPQ96GD0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDXPQ96GD0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDXPQ96GD0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDXPQ96GD0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDXPQ96GD0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDXPQ96GD0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDXPQ96GD0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDXPQ96GD0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms