Protein–RNA interactions for Protein: Q96G25

MED8, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED8Q96G25 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MED8Q96G25 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MED8Q96G25 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MED8Q96G25 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MED8Q96G25 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MED8Q96G25 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MED8Q96G25 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MED8Q96G25 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MED8Q96G25 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MED8Q96G25 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MED8Q96G25 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MED8Q96G25 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MED8Q96G25 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MED8Q96G25 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MED8Q96G25 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MED8Q96G25 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MED8Q96G25 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MED8Q96G25 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MED8Q96G25 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MED8Q96G25 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MED8Q96G25 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MED8Q96G25 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MED8Q96G25 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MED8Q96G25 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MED8Q96G25 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MED8Q96G25 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MED8Q96G25 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MED8Q96G25 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MED8Q96G25 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MED8Q96G25 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MED8Q96G25 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MED8Q96G25 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MED8Q96G25 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MED8Q96G25 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MED8Q96G25 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MED8Q96G25 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MED8Q96G25 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MED8Q96G25 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MED8Q96G25 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED8Q96G25 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED8Q96G25 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED8Q96G25 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED8Q96G25 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MED8Q96G25 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED8Q96G25 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED8Q96G25 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED8Q96G25 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED8Q96G25 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MED8Q96G25 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED8Q96G25 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MED8Q96G25 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MED8Q96G25 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MED8Q96G25 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MED8Q96G25 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MED8Q96G25 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED8Q96G25 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED8Q96G25 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED8Q96G25 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED8Q96G25 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED8Q96G25 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED8Q96G25 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED8Q96G25 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED8Q96G25 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED8Q96G25 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MED8Q96G25 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED8Q96G25 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED8Q96G25 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED8Q96G25 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED8Q96G25 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MED8Q96G25 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MED8Q96G25 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MED8Q96G25 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MED8Q96G25 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MED8Q96G25 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MED8Q96G25 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MED8Q96G25 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MED8Q96G25 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MED8Q96G25 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MED8Q96G25 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MED8Q96G25 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MED8Q96G25 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MED8Q96G25 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MED8Q96G25 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MED8Q96G25 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MED8Q96G25 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MED8Q96G25 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MED8Q96G25 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MED8Q96G25 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MED8Q96G25 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MED8Q96G25 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MED8Q96G25 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MED8Q96G25 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MED8Q96G25 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MED8Q96G25 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MED8Q96G25 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MED8Q96G25 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MED8Q96G25 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MED8Q96G25 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MED8Q96G25 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MED8Q96G25 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms