Protein–RNA interactions for Protein: Q96FZ5

CMTM7, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM7Q96FZ5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CMTM7Q96FZ5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CMTM7Q96FZ5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CMTM7Q96FZ5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CMTM7Q96FZ5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CMTM7Q96FZ5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CMTM7Q96FZ5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CMTM7Q96FZ5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CMTM7Q96FZ5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CMTM7Q96FZ5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CMTM7Q96FZ5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CMTM7Q96FZ5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CMTM7Q96FZ5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CMTM7Q96FZ5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CMTM7Q96FZ5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CMTM7Q96FZ5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CMTM7Q96FZ5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CMTM7Q96FZ5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CMTM7Q96FZ5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CMTM7Q96FZ5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CMTM7Q96FZ5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CMTM7Q96FZ5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CMTM7Q96FZ5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CMTM7Q96FZ5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CMTM7Q96FZ5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CMTM7Q96FZ5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CMTM7Q96FZ5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CMTM7Q96FZ5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CMTM7Q96FZ5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CMTM7Q96FZ5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CMTM7Q96FZ5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CMTM7Q96FZ5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CMTM7Q96FZ5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CMTM7Q96FZ5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CMTM7Q96FZ5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CMTM7Q96FZ5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CMTM7Q96FZ5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CMTM7Q96FZ5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CMTM7Q96FZ5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CMTM7Q96FZ5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CMTM7Q96FZ5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CMTM7Q96FZ5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CMTM7Q96FZ5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CMTM7Q96FZ5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CMTM7Q96FZ5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CMTM7Q96FZ5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CMTM7Q96FZ5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CMTM7Q96FZ5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CMTM7Q96FZ5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CMTM7Q96FZ5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CMTM7Q96FZ5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CMTM7Q96FZ5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CMTM7Q96FZ5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CMTM7Q96FZ5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CMTM7Q96FZ5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CMTM7Q96FZ5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CMTM7Q96FZ5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CMTM7Q96FZ5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CMTM7Q96FZ5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CMTM7Q96FZ5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CMTM7Q96FZ5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CMTM7Q96FZ5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CMTM7Q96FZ5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CMTM7Q96FZ5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CMTM7Q96FZ5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CMTM7Q96FZ5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CMTM7Q96FZ5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CMTM7Q96FZ5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CMTM7Q96FZ5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CMTM7Q96FZ5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CMTM7Q96FZ5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CMTM7Q96FZ5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CMTM7Q96FZ5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CMTM7Q96FZ5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CMTM7Q96FZ5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CMTM7Q96FZ5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CMTM7Q96FZ5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CMTM7Q96FZ5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CMTM7Q96FZ5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CMTM7Q96FZ5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CMTM7Q96FZ5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CMTM7Q96FZ5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CMTM7Q96FZ5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CMTM7Q96FZ5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CMTM7Q96FZ5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CMTM7Q96FZ5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CMTM7Q96FZ5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CMTM7Q96FZ5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CMTM7Q96FZ5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CMTM7Q96FZ5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CMTM7Q96FZ5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CMTM7Q96FZ5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CMTM7Q96FZ5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CMTM7Q96FZ5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CMTM7Q96FZ5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CMTM7Q96FZ5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CMTM7Q96FZ5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CMTM7Q96FZ5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CMTM7Q96FZ5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CMTM7Q96FZ5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms