Protein–RNA interactions for Protein: Q96FE5

LINGO1, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO1Q96FE5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINGO1Q96FE5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINGO1Q96FE5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINGO1Q96FE5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINGO1Q96FE5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINGO1Q96FE5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINGO1Q96FE5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINGO1Q96FE5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINGO1Q96FE5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LINGO1Q96FE5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINGO1Q96FE5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINGO1Q96FE5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINGO1Q96FE5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINGO1Q96FE5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINGO1Q96FE5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINGO1Q96FE5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINGO1Q96FE5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LINGO1Q96FE5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINGO1Q96FE5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINGO1Q96FE5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINGO1Q96FE5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LINGO1Q96FE5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LINGO1Q96FE5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINGO1Q96FE5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LINGO1Q96FE5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINGO1Q96FE5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINGO1Q96FE5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINGO1Q96FE5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINGO1Q96FE5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LINGO1Q96FE5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINGO1Q96FE5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINGO1Q96FE5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINGO1Q96FE5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINGO1Q96FE5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINGO1Q96FE5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINGO1Q96FE5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINGO1Q96FE5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINGO1Q96FE5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LINGO1Q96FE5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINGO1Q96FE5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINGO1Q96FE5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINGO1Q96FE5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINGO1Q96FE5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINGO1Q96FE5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINGO1Q96FE5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LINGO1Q96FE5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINGO1Q96FE5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINGO1Q96FE5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINGO1Q96FE5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINGO1Q96FE5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINGO1Q96FE5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINGO1Q96FE5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINGO1Q96FE5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINGO1Q96FE5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINGO1Q96FE5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINGO1Q96FE5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINGO1Q96FE5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINGO1Q96FE5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINGO1Q96FE5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINGO1Q96FE5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LINGO1Q96FE5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINGO1Q96FE5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINGO1Q96FE5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINGO1Q96FE5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINGO1Q96FE5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINGO1Q96FE5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINGO1Q96FE5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINGO1Q96FE5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LINGO1Q96FE5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINGO1Q96FE5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINGO1Q96FE5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINGO1Q96FE5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINGO1Q96FE5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINGO1Q96FE5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINGO1Q96FE5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LINGO1Q96FE5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LINGO1Q96FE5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINGO1Q96FE5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINGO1Q96FE5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINGO1Q96FE5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINGO1Q96FE5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINGO1Q96FE5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINGO1Q96FE5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINGO1Q96FE5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINGO1Q96FE5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINGO1Q96FE5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINGO1Q96FE5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINGO1Q96FE5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LINGO1Q96FE5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
LINGO1Q96FE5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINGO1Q96FE5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINGO1Q96FE5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINGO1Q96FE5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINGO1Q96FE5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LINGO1Q96FE5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINGO1Q96FE5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINGO1Q96FE5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINGO1Q96FE5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINGO1Q96FE5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINGO1Q96FE5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms