Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
EDC3Q96F86 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EDC3Q96F86 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EDC3Q96F86 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
EDC3Q96F86 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
EDC3Q96F86 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EDC3Q96F86 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
EDC3Q96F86 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EDC3Q96F86 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
EDC3Q96F86 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EDC3Q96F86 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EDC3Q96F86 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EDC3Q96F86 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
EDC3Q96F86 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
EDC3Q96F86 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
EDC3Q96F86 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
EDC3Q96F86 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
EDC3Q96F86 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EDC3Q96F86 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EDC3Q96F86 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
EDC3Q96F86 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
EDC3Q96F86 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
EDC3Q96F86 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
EDC3Q96F86 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
EDC3Q96F86 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
EDC3Q96F86 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
EDC3Q96F86 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
EDC3Q96F86 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
EDC3Q96F86 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
EDC3Q96F86 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
EDC3Q96F86 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
EDC3Q96F86 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
EDC3Q96F86 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
EDC3Q96F86 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
EDC3Q96F86 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EDC3Q96F86 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
EDC3Q96F86 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
EDC3Q96F86 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EDC3Q96F86 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
EDC3Q96F86 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
EDC3Q96F86 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
EDC3Q96F86 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
EDC3Q96F86 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
EDC3Q96F86 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
EDC3Q96F86 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
EDC3Q96F86 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
EDC3Q96F86 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
EDC3Q96F86 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
EDC3Q96F86 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
EDC3Q96F86 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
EDC3Q96F86 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
EDC3Q96F86 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
EDC3Q96F86 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
EDC3Q96F86 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
EDC3Q96F86 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
EDC3Q96F86 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
EDC3Q96F86 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EDC3Q96F86 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EDC3Q96F86 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EDC3Q96F86 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EDC3Q96F86 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
EDC3Q96F86 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
EDC3Q96F86 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EDC3Q96F86 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EDC3Q96F86 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EDC3Q96F86 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EDC3Q96F86 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EDC3Q96F86 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EDC3Q96F86 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EDC3Q96F86 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EDC3Q96F86 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
EDC3Q96F86 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
EDC3Q96F86 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
EDC3Q96F86 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
EDC3Q96F86 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
EDC3Q96F86 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
EDC3Q96F86 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
EDC3Q96F86 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
EDC3Q96F86 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
EDC3Q96F86 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
EDC3Q96F86 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
EDC3Q96F86 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
EDC3Q96F86 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
EDC3Q96F86 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
EDC3Q96F86 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EDC3Q96F86 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
EDC3Q96F86 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EDC3Q96F86 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
EDC3Q96F86 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
EDC3Q96F86 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
EDC3Q96F86 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
EDC3Q96F86 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
EDC3Q96F86 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
EDC3Q96F86 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
EDC3Q96F86 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
EDC3Q96F86 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
EDC3Q96F86 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
EDC3Q96F86 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
EDC3Q96F86 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
EDC3Q96F86 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms