Protein–RNA interactions for Protein: Q96E22

NUS1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit NUS1, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUS1Q96E22 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUS1Q96E22 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUS1Q96E22 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUS1Q96E22 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUS1Q96E22 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUS1Q96E22 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUS1Q96E22 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUS1Q96E22 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NUS1Q96E22 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUS1Q96E22 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NUS1Q96E22 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUS1Q96E22 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUS1Q96E22 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUS1Q96E22 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUS1Q96E22 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUS1Q96E22 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUS1Q96E22 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUS1Q96E22 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUS1Q96E22 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUS1Q96E22 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUS1Q96E22 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUS1Q96E22 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NUS1Q96E22 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUS1Q96E22 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUS1Q96E22 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUS1Q96E22 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUS1Q96E22 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUS1Q96E22 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUS1Q96E22 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUS1Q96E22 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUS1Q96E22 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUS1Q96E22 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUS1Q96E22 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUS1Q96E22 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUS1Q96E22 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUS1Q96E22 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NUS1Q96E22 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUS1Q96E22 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NUS1Q96E22 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUS1Q96E22 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUS1Q96E22 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUS1Q96E22 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUS1Q96E22 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUS1Q96E22 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUS1Q96E22 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUS1Q96E22 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUS1Q96E22 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUS1Q96E22 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUS1Q96E22 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUS1Q96E22 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUS1Q96E22 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NUS1Q96E22 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUS1Q96E22 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUS1Q96E22 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUS1Q96E22 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NUS1Q96E22 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUS1Q96E22 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUS1Q96E22 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUS1Q96E22 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUS1Q96E22 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUS1Q96E22 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUS1Q96E22 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUS1Q96E22 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUS1Q96E22 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUS1Q96E22 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUS1Q96E22 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUS1Q96E22 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUS1Q96E22 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUS1Q96E22 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUS1Q96E22 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUS1Q96E22 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUS1Q96E22 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUS1Q96E22 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUS1Q96E22 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUS1Q96E22 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUS1Q96E22 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NUS1Q96E22 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUS1Q96E22 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUS1Q96E22 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUS1Q96E22 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUS1Q96E22 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUS1Q96E22 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUS1Q96E22 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUS1Q96E22 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUS1Q96E22 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUS1Q96E22 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUS1Q96E22 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUS1Q96E22 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUS1Q96E22 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUS1Q96E22 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUS1Q96E22 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUS1Q96E22 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUS1Q96E22 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUS1Q96E22 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUS1Q96E22 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUS1Q96E22 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUS1Q96E22 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUS1Q96E22 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUS1Q96E22 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUS1Q96E22 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms