Protein–RNA interactions for Protein: Q96DS6

MS4A6E, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6E, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A6EQ96DS6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A6EQ96DS6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A6EQ96DS6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A6EQ96DS6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A6EQ96DS6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A6EQ96DS6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A6EQ96DS6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A6EQ96DS6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A6EQ96DS6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A6EQ96DS6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A6EQ96DS6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A6EQ96DS6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A6EQ96DS6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A6EQ96DS6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A6EQ96DS6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A6EQ96DS6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A6EQ96DS6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A6EQ96DS6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A6EQ96DS6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A6EQ96DS6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A6EQ96DS6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A6EQ96DS6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A6EQ96DS6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A6EQ96DS6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A6EQ96DS6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A6EQ96DS6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A6EQ96DS6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A6EQ96DS6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MS4A6EQ96DS6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A6EQ96DS6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A6EQ96DS6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A6EQ96DS6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A6EQ96DS6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A6EQ96DS6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A6EQ96DS6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A6EQ96DS6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A6EQ96DS6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A6EQ96DS6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A6EQ96DS6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A6EQ96DS6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A6EQ96DS6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A6EQ96DS6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A6EQ96DS6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A6EQ96DS6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A6EQ96DS6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A6EQ96DS6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A6EQ96DS6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A6EQ96DS6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A6EQ96DS6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A6EQ96DS6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A6EQ96DS6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A6EQ96DS6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A6EQ96DS6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A6EQ96DS6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A6EQ96DS6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A6EQ96DS6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A6EQ96DS6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A6EQ96DS6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A6EQ96DS6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A6EQ96DS6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A6EQ96DS6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A6EQ96DS6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A6EQ96DS6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A6EQ96DS6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A6EQ96DS6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A6EQ96DS6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A6EQ96DS6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A6EQ96DS6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A6EQ96DS6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A6EQ96DS6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MS4A6EQ96DS6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MS4A6EQ96DS6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MS4A6EQ96DS6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MS4A6EQ96DS6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MS4A6EQ96DS6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MS4A6EQ96DS6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MS4A6EQ96DS6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MS4A6EQ96DS6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MS4A6EQ96DS6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MS4A6EQ96DS6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MS4A6EQ96DS6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MS4A6EQ96DS6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MS4A6EQ96DS6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MS4A6EQ96DS6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MS4A6EQ96DS6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A6EQ96DS6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A6EQ96DS6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A6EQ96DS6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A6EQ96DS6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A6EQ96DS6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A6EQ96DS6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A6EQ96DS6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A6EQ96DS6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A6EQ96DS6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A6EQ96DS6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A6EQ96DS6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A6EQ96DS6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A6EQ96DS6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A6EQ96DS6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A6EQ96DS6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms