Protein–RNA interactions for Protein: Q96DL1

NXPE2, NXPE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE2Q96DL1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NXPE2Q96DL1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NXPE2Q96DL1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NXPE2Q96DL1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NXPE2Q96DL1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NXPE2Q96DL1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NXPE2Q96DL1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NXPE2Q96DL1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NXPE2Q96DL1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NXPE2Q96DL1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NXPE2Q96DL1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NXPE2Q96DL1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NXPE2Q96DL1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NXPE2Q96DL1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NXPE2Q96DL1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NXPE2Q96DL1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NXPE2Q96DL1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NXPE2Q96DL1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NXPE2Q96DL1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NXPE2Q96DL1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NXPE2Q96DL1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NXPE2Q96DL1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NXPE2Q96DL1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NXPE2Q96DL1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NXPE2Q96DL1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NXPE2Q96DL1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NXPE2Q96DL1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NXPE2Q96DL1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NXPE2Q96DL1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NXPE2Q96DL1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NXPE2Q96DL1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NXPE2Q96DL1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NXPE2Q96DL1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NXPE2Q96DL1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NXPE2Q96DL1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NXPE2Q96DL1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NXPE2Q96DL1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NXPE2Q96DL1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NXPE2Q96DL1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NXPE2Q96DL1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NXPE2Q96DL1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NXPE2Q96DL1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NXPE2Q96DL1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NXPE2Q96DL1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NXPE2Q96DL1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NXPE2Q96DL1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NXPE2Q96DL1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NXPE2Q96DL1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NXPE2Q96DL1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NXPE2Q96DL1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NXPE2Q96DL1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NXPE2Q96DL1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NXPE2Q96DL1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NXPE2Q96DL1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NXPE2Q96DL1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NXPE2Q96DL1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NXPE2Q96DL1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NXPE2Q96DL1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NXPE2Q96DL1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NXPE2Q96DL1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NXPE2Q96DL1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NXPE2Q96DL1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NXPE2Q96DL1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NXPE2Q96DL1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NXPE2Q96DL1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NXPE2Q96DL1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NXPE2Q96DL1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NXPE2Q96DL1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NXPE2Q96DL1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NXPE2Q96DL1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NXPE2Q96DL1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NXPE2Q96DL1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NXPE2Q96DL1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NXPE2Q96DL1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NXPE2Q96DL1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NXPE2Q96DL1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NXPE2Q96DL1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NXPE2Q96DL1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NXPE2Q96DL1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NXPE2Q96DL1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NXPE2Q96DL1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NXPE2Q96DL1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NXPE2Q96DL1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NXPE2Q96DL1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NXPE2Q96DL1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NXPE2Q96DL1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NXPE2Q96DL1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NXPE2Q96DL1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NXPE2Q96DL1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NXPE2Q96DL1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NXPE2Q96DL1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NXPE2Q96DL1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NXPE2Q96DL1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NXPE2Q96DL1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NXPE2Q96DL1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NXPE2Q96DL1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NXPE2Q96DL1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NXPE2Q96DL1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NXPE2Q96DL1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NXPE2Q96DL1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms