Protein–RNA interactions for Protein: Q96D15

RCN3, Reticulocalbin-3, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN3Q96D15 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCN3Q96D15 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCN3Q96D15 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCN3Q96D15 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCN3Q96D15 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RCN3Q96D15 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RCN3Q96D15 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RCN3Q96D15 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RCN3Q96D15 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RCN3Q96D15 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RCN3Q96D15 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RCN3Q96D15 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RCN3Q96D15 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RCN3Q96D15 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RCN3Q96D15 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RCN3Q96D15 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RCN3Q96D15 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RCN3Q96D15 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RCN3Q96D15 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RCN3Q96D15 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RCN3Q96D15 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RCN3Q96D15 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RCN3Q96D15 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RCN3Q96D15 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RCN3Q96D15 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RCN3Q96D15 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RCN3Q96D15 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RCN3Q96D15 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RCN3Q96D15 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RCN3Q96D15 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RCN3Q96D15 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RCN3Q96D15 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCN3Q96D15 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RCN3Q96D15 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCN3Q96D15 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCN3Q96D15 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCN3Q96D15 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCN3Q96D15 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCN3Q96D15 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RCN3Q96D15 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RCN3Q96D15 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RCN3Q96D15 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RCN3Q96D15 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RCN3Q96D15 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RCN3Q96D15 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RCN3Q96D15 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RCN3Q96D15 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RCN3Q96D15 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RCN3Q96D15 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RCN3Q96D15 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RCN3Q96D15 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RCN3Q96D15 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RCN3Q96D15 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RCN3Q96D15 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RCN3Q96D15 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RCN3Q96D15 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RCN3Q96D15 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RCN3Q96D15 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RCN3Q96D15 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RCN3Q96D15 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCN3Q96D15 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCN3Q96D15 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCN3Q96D15 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCN3Q96D15 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCN3Q96D15 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCN3Q96D15 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RCN3Q96D15 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RCN3Q96D15 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RCN3Q96D15 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RCN3Q96D15 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RCN3Q96D15 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RCN3Q96D15 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RCN3Q96D15 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RCN3Q96D15 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RCN3Q96D15 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RCN3Q96D15 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCN3Q96D15 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCN3Q96D15 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCN3Q96D15 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RCN3Q96D15 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RCN3Q96D15 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RCN3Q96D15 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RCN3Q96D15 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RCN3Q96D15 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RCN3Q96D15 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RCN3Q96D15 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RCN3Q96D15 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RCN3Q96D15 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RCN3Q96D15 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RCN3Q96D15 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RCN3Q96D15 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RCN3Q96D15 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RCN3Q96D15 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RCN3Q96D15 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RCN3Q96D15 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RCN3Q96D15 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RCN3Q96D15 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCN3Q96D15 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCN3Q96D15 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCN3Q96D15 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms