Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP6

GRAMD1A, GRAM domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1AQ96CP6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRAMD1AQ96CP6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRAMD1AQ96CP6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRAMD1AQ96CP6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GRAMD1AQ96CP6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRAMD1AQ96CP6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRAMD1AQ96CP6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRAMD1AQ96CP6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRAMD1AQ96CP6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRAMD1AQ96CP6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GRAMD1AQ96CP6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRAMD1AQ96CP6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GRAMD1AQ96CP6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRAMD1AQ96CP6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRAMD1AQ96CP6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRAMD1AQ96CP6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRAMD1AQ96CP6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRAMD1AQ96CP6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRAMD1AQ96CP6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRAMD1AQ96CP6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRAMD1AQ96CP6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRAMD1AQ96CP6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRAMD1AQ96CP6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRAMD1AQ96CP6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRAMD1AQ96CP6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRAMD1AQ96CP6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRAMD1AQ96CP6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRAMD1AQ96CP6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRAMD1AQ96CP6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRAMD1AQ96CP6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRAMD1AQ96CP6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRAMD1AQ96CP6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRAMD1AQ96CP6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRAMD1AQ96CP6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRAMD1AQ96CP6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRAMD1AQ96CP6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRAMD1AQ96CP6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRAMD1AQ96CP6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRAMD1AQ96CP6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRAMD1AQ96CP6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRAMD1AQ96CP6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRAMD1AQ96CP6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRAMD1AQ96CP6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRAMD1AQ96CP6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRAMD1AQ96CP6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRAMD1AQ96CP6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRAMD1AQ96CP6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRAMD1AQ96CP6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRAMD1AQ96CP6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRAMD1AQ96CP6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRAMD1AQ96CP6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRAMD1AQ96CP6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRAMD1AQ96CP6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRAMD1AQ96CP6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRAMD1AQ96CP6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRAMD1AQ96CP6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GRAMD1AQ96CP6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRAMD1AQ96CP6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRAMD1AQ96CP6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRAMD1AQ96CP6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRAMD1AQ96CP6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRAMD1AQ96CP6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRAMD1AQ96CP6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRAMD1AQ96CP6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GRAMD1AQ96CP6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRAMD1AQ96CP6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GRAMD1AQ96CP6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRAMD1AQ96CP6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRAMD1AQ96CP6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRAMD1AQ96CP6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRAMD1AQ96CP6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GRAMD1AQ96CP6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRAMD1AQ96CP6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRAMD1AQ96CP6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRAMD1AQ96CP6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRAMD1AQ96CP6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRAMD1AQ96CP6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRAMD1AQ96CP6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRAMD1AQ96CP6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRAMD1AQ96CP6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRAMD1AQ96CP6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRAMD1AQ96CP6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRAMD1AQ96CP6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRAMD1AQ96CP6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GRAMD1AQ96CP6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRAMD1AQ96CP6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRAMD1AQ96CP6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRAMD1AQ96CP6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRAMD1AQ96CP6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRAMD1AQ96CP6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRAMD1AQ96CP6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRAMD1AQ96CP6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRAMD1AQ96CP6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRAMD1AQ96CP6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRAMD1AQ96CP6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRAMD1AQ96CP6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRAMD1AQ96CP6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRAMD1AQ96CP6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRAMD1AQ96CP6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRAMD1AQ96CP6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms