Protein–RNA interactions for Protein: Q96CD2

PPCDC, Phosphopantothenoylcysteine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPCDCQ96CD2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPCDCQ96CD2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPCDCQ96CD2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPCDCQ96CD2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPCDCQ96CD2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPCDCQ96CD2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPCDCQ96CD2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPCDCQ96CD2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPCDCQ96CD2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PPCDCQ96CD2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPCDCQ96CD2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPCDCQ96CD2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPCDCQ96CD2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPCDCQ96CD2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPCDCQ96CD2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPCDCQ96CD2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PPCDCQ96CD2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPCDCQ96CD2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPCDCQ96CD2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPCDCQ96CD2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPCDCQ96CD2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPCDCQ96CD2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPCDCQ96CD2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPCDCQ96CD2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPCDCQ96CD2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPCDCQ96CD2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPCDCQ96CD2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PPCDCQ96CD2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPCDCQ96CD2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PPCDCQ96CD2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPCDCQ96CD2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPCDCQ96CD2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPCDCQ96CD2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPCDCQ96CD2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPCDCQ96CD2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPCDCQ96CD2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPCDCQ96CD2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPCDCQ96CD2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPCDCQ96CD2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPCDCQ96CD2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPCDCQ96CD2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPCDCQ96CD2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPCDCQ96CD2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPCDCQ96CD2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPCDCQ96CD2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPCDCQ96CD2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPCDCQ96CD2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPCDCQ96CD2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPCDCQ96CD2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPCDCQ96CD2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPCDCQ96CD2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPCDCQ96CD2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPCDCQ96CD2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPCDCQ96CD2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPCDCQ96CD2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPCDCQ96CD2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPCDCQ96CD2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPCDCQ96CD2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPCDCQ96CD2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPCDCQ96CD2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPCDCQ96CD2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPCDCQ96CD2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPCDCQ96CD2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPCDCQ96CD2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPCDCQ96CD2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPCDCQ96CD2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPCDCQ96CD2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPCDCQ96CD2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPCDCQ96CD2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPCDCQ96CD2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPCDCQ96CD2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPCDCQ96CD2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPCDCQ96CD2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPCDCQ96CD2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPCDCQ96CD2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPCDCQ96CD2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPCDCQ96CD2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPCDCQ96CD2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPCDCQ96CD2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPCDCQ96CD2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPCDCQ96CD2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPCDCQ96CD2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPCDCQ96CD2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPCDCQ96CD2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPCDCQ96CD2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPCDCQ96CD2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPCDCQ96CD2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPCDCQ96CD2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PPCDCQ96CD2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPCDCQ96CD2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPCDCQ96CD2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPCDCQ96CD2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPCDCQ96CD2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPCDCQ96CD2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPCDCQ96CD2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPCDCQ96CD2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPCDCQ96CD2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPCDCQ96CD2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPCDCQ96CD2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPCDCQ96CD2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms