Protein–RNA interactions for Protein: Q96CC6

RHBDF1, Inactive rhomboid protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF1Q96CC6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHBDF1Q96CC6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHBDF1Q96CC6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHBDF1Q96CC6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHBDF1Q96CC6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHBDF1Q96CC6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHBDF1Q96CC6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHBDF1Q96CC6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHBDF1Q96CC6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RHBDF1Q96CC6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHBDF1Q96CC6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RHBDF1Q96CC6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHBDF1Q96CC6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHBDF1Q96CC6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHBDF1Q96CC6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHBDF1Q96CC6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHBDF1Q96CC6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHBDF1Q96CC6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHBDF1Q96CC6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHBDF1Q96CC6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHBDF1Q96CC6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHBDF1Q96CC6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RHBDF1Q96CC6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHBDF1Q96CC6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHBDF1Q96CC6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
RHBDF1Q96CC6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHBDF1Q96CC6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHBDF1Q96CC6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHBDF1Q96CC6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHBDF1Q96CC6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHBDF1Q96CC6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHBDF1Q96CC6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHBDF1Q96CC6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHBDF1Q96CC6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RHBDF1Q96CC6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHBDF1Q96CC6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHBDF1Q96CC6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHBDF1Q96CC6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHBDF1Q96CC6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHBDF1Q96CC6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHBDF1Q96CC6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHBDF1Q96CC6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHBDF1Q96CC6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHBDF1Q96CC6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHBDF1Q96CC6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHBDF1Q96CC6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHBDF1Q96CC6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHBDF1Q96CC6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHBDF1Q96CC6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHBDF1Q96CC6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHBDF1Q96CC6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHBDF1Q96CC6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RHBDF1Q96CC6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHBDF1Q96CC6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHBDF1Q96CC6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHBDF1Q96CC6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHBDF1Q96CC6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHBDF1Q96CC6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHBDF1Q96CC6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHBDF1Q96CC6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHBDF1Q96CC6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHBDF1Q96CC6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RHBDF1Q96CC6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHBDF1Q96CC6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHBDF1Q96CC6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHBDF1Q96CC6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHBDF1Q96CC6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHBDF1Q96CC6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHBDF1Q96CC6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHBDF1Q96CC6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHBDF1Q96CC6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHBDF1Q96CC6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHBDF1Q96CC6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHBDF1Q96CC6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RHBDF1Q96CC6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHBDF1Q96CC6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHBDF1Q96CC6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHBDF1Q96CC6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHBDF1Q96CC6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RHBDF1Q96CC6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHBDF1Q96CC6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RHBDF1Q96CC6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHBDF1Q96CC6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHBDF1Q96CC6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHBDF1Q96CC6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHBDF1Q96CC6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHBDF1Q96CC6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHBDF1Q96CC6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHBDF1Q96CC6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHBDF1Q96CC6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHBDF1Q96CC6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHBDF1Q96CC6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHBDF1Q96CC6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHBDF1Q96CC6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RHBDF1Q96CC6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHBDF1Q96CC6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHBDF1Q96CC6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHBDF1Q96CC6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHBDF1Q96CC6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHBDF1Q96CC6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms