Protein–RNA interactions for Protein: Q96C92

SDCCAG3, Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3Q96C92 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDCCAG3Q96C92 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDCCAG3Q96C92 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDCCAG3Q96C92 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDCCAG3Q96C92 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDCCAG3Q96C92 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDCCAG3Q96C92 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDCCAG3Q96C92 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDCCAG3Q96C92 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDCCAG3Q96C92 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SDCCAG3Q96C92 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SDCCAG3Q96C92 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SDCCAG3Q96C92 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDCCAG3Q96C92 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDCCAG3Q96C92 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDCCAG3Q96C92 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDCCAG3Q96C92 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDCCAG3Q96C92 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDCCAG3Q96C92 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDCCAG3Q96C92 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDCCAG3Q96C92 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDCCAG3Q96C92 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDCCAG3Q96C92 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDCCAG3Q96C92 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDCCAG3Q96C92 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDCCAG3Q96C92 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDCCAG3Q96C92 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDCCAG3Q96C92 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDCCAG3Q96C92 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDCCAG3Q96C92 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SDCCAG3Q96C92 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDCCAG3Q96C92 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDCCAG3Q96C92 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDCCAG3Q96C92 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDCCAG3Q96C92 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDCCAG3Q96C92 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDCCAG3Q96C92 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDCCAG3Q96C92 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDCCAG3Q96C92 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDCCAG3Q96C92 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDCCAG3Q96C92 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDCCAG3Q96C92 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SDCCAG3Q96C92 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDCCAG3Q96C92 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDCCAG3Q96C92 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDCCAG3Q96C92 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDCCAG3Q96C92 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDCCAG3Q96C92 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDCCAG3Q96C92 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SDCCAG3Q96C92 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SDCCAG3Q96C92 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDCCAG3Q96C92 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDCCAG3Q96C92 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SDCCAG3Q96C92 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDCCAG3Q96C92 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDCCAG3Q96C92 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDCCAG3Q96C92 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDCCAG3Q96C92 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDCCAG3Q96C92 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDCCAG3Q96C92 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDCCAG3Q96C92 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDCCAG3Q96C92 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDCCAG3Q96C92 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDCCAG3Q96C92 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDCCAG3Q96C92 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDCCAG3Q96C92 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SDCCAG3Q96C92 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDCCAG3Q96C92 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDCCAG3Q96C92 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDCCAG3Q96C92 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDCCAG3Q96C92 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDCCAG3Q96C92 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDCCAG3Q96C92 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDCCAG3Q96C92 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDCCAG3Q96C92 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDCCAG3Q96C92 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDCCAG3Q96C92 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDCCAG3Q96C92 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SDCCAG3Q96C92 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SDCCAG3Q96C92 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDCCAG3Q96C92 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDCCAG3Q96C92 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDCCAG3Q96C92 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDCCAG3Q96C92 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SDCCAG3Q96C92 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDCCAG3Q96C92 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDCCAG3Q96C92 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SDCCAG3Q96C92 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDCCAG3Q96C92 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDCCAG3Q96C92 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDCCAG3Q96C92 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SDCCAG3Q96C92 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDCCAG3Q96C92 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDCCAG3Q96C92 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDCCAG3Q96C92 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDCCAG3Q96C92 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDCCAG3Q96C92 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDCCAG3Q96C92 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDCCAG3Q96C92 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDCCAG3Q96C92 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms