Protein–RNA interactions for Protein: Q96BT1

C3orf49, Putative uncharacterized protein C3orf49, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf49Q96BT1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C3orf49Q96BT1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C3orf49Q96BT1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C3orf49Q96BT1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C3orf49Q96BT1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C3orf49Q96BT1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C3orf49Q96BT1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C3orf49Q96BT1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C3orf49Q96BT1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C3orf49Q96BT1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C3orf49Q96BT1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C3orf49Q96BT1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C3orf49Q96BT1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C3orf49Q96BT1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C3orf49Q96BT1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C3orf49Q96BT1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
C3orf49Q96BT1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C3orf49Q96BT1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C3orf49Q96BT1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C3orf49Q96BT1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
C3orf49Q96BT1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C3orf49Q96BT1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C3orf49Q96BT1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C3orf49Q96BT1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C3orf49Q96BT1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C3orf49Q96BT1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C3orf49Q96BT1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C3orf49Q96BT1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C3orf49Q96BT1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C3orf49Q96BT1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C3orf49Q96BT1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C3orf49Q96BT1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C3orf49Q96BT1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
C3orf49Q96BT1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C3orf49Q96BT1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C3orf49Q96BT1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C3orf49Q96BT1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C3orf49Q96BT1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C3orf49Q96BT1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
C3orf49Q96BT1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C3orf49Q96BT1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C3orf49Q96BT1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C3orf49Q96BT1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C3orf49Q96BT1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C3orf49Q96BT1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C3orf49Q96BT1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C3orf49Q96BT1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C3orf49Q96BT1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C3orf49Q96BT1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C3orf49Q96BT1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C3orf49Q96BT1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C3orf49Q96BT1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C3orf49Q96BT1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
C3orf49Q96BT1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C3orf49Q96BT1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C3orf49Q96BT1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C3orf49Q96BT1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C3orf49Q96BT1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C3orf49Q96BT1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C3orf49Q96BT1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C3orf49Q96BT1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C3orf49Q96BT1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C3orf49Q96BT1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C3orf49Q96BT1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C3orf49Q96BT1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C3orf49Q96BT1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C3orf49Q96BT1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C3orf49Q96BT1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C3orf49Q96BT1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C3orf49Q96BT1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C3orf49Q96BT1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C3orf49Q96BT1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C3orf49Q96BT1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C3orf49Q96BT1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C3orf49Q96BT1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C3orf49Q96BT1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C3orf49Q96BT1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
C3orf49Q96BT1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C3orf49Q96BT1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
C3orf49Q96BT1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C3orf49Q96BT1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
C3orf49Q96BT1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C3orf49Q96BT1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C3orf49Q96BT1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C3orf49Q96BT1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
C3orf49Q96BT1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C3orf49Q96BT1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C3orf49Q96BT1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C3orf49Q96BT1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C3orf49Q96BT1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C3orf49Q96BT1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C3orf49Q96BT1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C3orf49Q96BT1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C3orf49Q96BT1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C3orf49Q96BT1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C3orf49Q96BT1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C3orf49Q96BT1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C3orf49Q96BT1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C3orf49Q96BT1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C3orf49Q96BT1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms