Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ5

CCDC127, Coiled-coil domain-containing protein 127, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC127Q96BQ5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC127Q96BQ5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC127Q96BQ5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC127Q96BQ5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC127Q96BQ5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC127Q96BQ5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC127Q96BQ5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC127Q96BQ5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC127Q96BQ5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC127Q96BQ5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC127Q96BQ5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC127Q96BQ5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC127Q96BQ5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC127Q96BQ5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC127Q96BQ5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC127Q96BQ5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC127Q96BQ5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC127Q96BQ5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC127Q96BQ5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC127Q96BQ5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC127Q96BQ5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC127Q96BQ5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC127Q96BQ5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC127Q96BQ5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC127Q96BQ5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC127Q96BQ5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC127Q96BQ5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC127Q96BQ5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC127Q96BQ5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC127Q96BQ5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC127Q96BQ5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC127Q96BQ5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC127Q96BQ5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC127Q96BQ5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC127Q96BQ5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC127Q96BQ5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC127Q96BQ5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC127Q96BQ5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC127Q96BQ5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC127Q96BQ5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC127Q96BQ5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC127Q96BQ5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC127Q96BQ5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC127Q96BQ5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC127Q96BQ5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC127Q96BQ5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC127Q96BQ5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC127Q96BQ5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC127Q96BQ5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC127Q96BQ5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC127Q96BQ5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC127Q96BQ5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC127Q96BQ5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC127Q96BQ5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC127Q96BQ5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC127Q96BQ5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC127Q96BQ5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC127Q96BQ5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC127Q96BQ5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC127Q96BQ5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC127Q96BQ5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC127Q96BQ5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC127Q96BQ5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC127Q96BQ5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC127Q96BQ5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC127Q96BQ5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC127Q96BQ5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC127Q96BQ5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC127Q96BQ5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC127Q96BQ5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC127Q96BQ5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC127Q96BQ5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC127Q96BQ5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC127Q96BQ5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC127Q96BQ5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC127Q96BQ5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC127Q96BQ5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC127Q96BQ5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC127Q96BQ5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC127Q96BQ5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC127Q96BQ5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC127Q96BQ5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC127Q96BQ5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC127Q96BQ5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC127Q96BQ5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC127Q96BQ5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC127Q96BQ5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC127Q96BQ5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC127Q96BQ5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC127Q96BQ5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC127Q96BQ5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC127Q96BQ5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC127Q96BQ5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC127Q96BQ5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC127Q96BQ5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC127Q96BQ5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC127Q96BQ5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC127Q96BQ5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC127Q96BQ5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC127Q96BQ5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms