Protein–RNA interactions for Protein: Q96AN5

TMEM143, Transmembrane protein 143, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM143Q96AN5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM143Q96AN5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM143Q96AN5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM143Q96AN5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM143Q96AN5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM143Q96AN5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM143Q96AN5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM143Q96AN5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM143Q96AN5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM143Q96AN5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM143Q96AN5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM143Q96AN5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM143Q96AN5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM143Q96AN5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM143Q96AN5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM143Q96AN5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM143Q96AN5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM143Q96AN5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM143Q96AN5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM143Q96AN5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM143Q96AN5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM143Q96AN5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM143Q96AN5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM143Q96AN5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM143Q96AN5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM143Q96AN5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM143Q96AN5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM143Q96AN5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TMEM143Q96AN5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TMEM143Q96AN5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM143Q96AN5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM143Q96AN5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM143Q96AN5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM143Q96AN5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM143Q96AN5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM143Q96AN5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM143Q96AN5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM143Q96AN5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM143Q96AN5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM143Q96AN5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM143Q96AN5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM143Q96AN5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM143Q96AN5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM143Q96AN5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM143Q96AN5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM143Q96AN5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM143Q96AN5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM143Q96AN5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM143Q96AN5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM143Q96AN5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM143Q96AN5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM143Q96AN5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM143Q96AN5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM143Q96AN5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM143Q96AN5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM143Q96AN5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM143Q96AN5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM143Q96AN5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM143Q96AN5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM143Q96AN5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMEM143Q96AN5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMEM143Q96AN5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TMEM143Q96AN5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMEM143Q96AN5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMEM143Q96AN5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMEM143Q96AN5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMEM143Q96AN5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMEM143Q96AN5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMEM143Q96AN5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMEM143Q96AN5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMEM143Q96AN5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMEM143Q96AN5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMEM143Q96AN5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMEM143Q96AN5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMEM143Q96AN5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMEM143Q96AN5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TMEM143Q96AN5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TMEM143Q96AN5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TMEM143Q96AN5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM143Q96AN5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM143Q96AN5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM143Q96AN5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM143Q96AN5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM143Q96AN5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM143Q96AN5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM143Q96AN5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM143Q96AN5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM143Q96AN5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM143Q96AN5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM143Q96AN5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMEM143Q96AN5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMEM143Q96AN5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMEM143Q96AN5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMEM143Q96AN5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMEM143Q96AN5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMEM143Q96AN5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMEM143Q96AN5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMEM143Q96AN5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMEM143Q96AN5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMEM143Q96AN5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms