Protein–RNA interactions for Protein: Q96A56

TP53INP1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53INP1Q96A56 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TP53INP1Q96A56 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TP53INP1Q96A56 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TP53INP1Q96A56 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TP53INP1Q96A56 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TP53INP1Q96A56 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TP53INP1Q96A56 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TP53INP1Q96A56 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TP53INP1Q96A56 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TP53INP1Q96A56 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TP53INP1Q96A56 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TP53INP1Q96A56 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TP53INP1Q96A56 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TP53INP1Q96A56 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TP53INP1Q96A56 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TP53INP1Q96A56 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TP53INP1Q96A56 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TP53INP1Q96A56 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TP53INP1Q96A56 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TP53INP1Q96A56 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TP53INP1Q96A56 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TP53INP1Q96A56 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TP53INP1Q96A56 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TP53INP1Q96A56 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TP53INP1Q96A56 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TP53INP1Q96A56 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TP53INP1Q96A56 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TP53INP1Q96A56 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TP53INP1Q96A56 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TP53INP1Q96A56 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TP53INP1Q96A56 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TP53INP1Q96A56 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TP53INP1Q96A56 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TP53INP1Q96A56 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TP53INP1Q96A56 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TP53INP1Q96A56 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TP53INP1Q96A56 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TP53INP1Q96A56 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TP53INP1Q96A56 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TP53INP1Q96A56 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TP53INP1Q96A56 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TP53INP1Q96A56 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TP53INP1Q96A56 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TP53INP1Q96A56 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TP53INP1Q96A56 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TP53INP1Q96A56 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TP53INP1Q96A56 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TP53INP1Q96A56 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TP53INP1Q96A56 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TP53INP1Q96A56 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TP53INP1Q96A56 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TP53INP1Q96A56 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TP53INP1Q96A56 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TP53INP1Q96A56 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TP53INP1Q96A56 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TP53INP1Q96A56 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TP53INP1Q96A56 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TP53INP1Q96A56 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TP53INP1Q96A56 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TP53INP1Q96A56 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TP53INP1Q96A56 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TP53INP1Q96A56 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TP53INP1Q96A56 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TP53INP1Q96A56 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TP53INP1Q96A56 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TP53INP1Q96A56 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TP53INP1Q96A56 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TP53INP1Q96A56 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TP53INP1Q96A56 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TP53INP1Q96A56 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TP53INP1Q96A56 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TP53INP1Q96A56 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TP53INP1Q96A56 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TP53INP1Q96A56 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TP53INP1Q96A56 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TP53INP1Q96A56 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TP53INP1Q96A56 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TP53INP1Q96A56 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TP53INP1Q96A56 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TP53INP1Q96A56 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TP53INP1Q96A56 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TP53INP1Q96A56 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TP53INP1Q96A56 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TP53INP1Q96A56 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TP53INP1Q96A56 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TP53INP1Q96A56 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TP53INP1Q96A56 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TP53INP1Q96A56 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TP53INP1Q96A56 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TP53INP1Q96A56 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TP53INP1Q96A56 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TP53INP1Q96A56 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TP53INP1Q96A56 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TP53INP1Q96A56 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TP53INP1Q96A56 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TP53INP1Q96A56 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TP53INP1Q96A56 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TP53INP1Q96A56 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TP53INP1Q96A56 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TP53INP1Q96A56 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms