Protein–RNA interactions for Protein: Q969V3

NCLN, Nicalin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLNQ969V3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NCLNQ969V3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCLNQ969V3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCLNQ969V3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCLNQ969V3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCLNQ969V3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCLNQ969V3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCLNQ969V3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCLNQ969V3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCLNQ969V3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCLNQ969V3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCLNQ969V3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCLNQ969V3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCLNQ969V3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCLNQ969V3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NCLNQ969V3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCLNQ969V3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCLNQ969V3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCLNQ969V3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NCLNQ969V3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCLNQ969V3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCLNQ969V3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCLNQ969V3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCLNQ969V3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCLNQ969V3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCLNQ969V3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCLNQ969V3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCLNQ969V3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCLNQ969V3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCLNQ969V3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCLNQ969V3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCLNQ969V3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCLNQ969V3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCLNQ969V3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCLNQ969V3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCLNQ969V3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCLNQ969V3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCLNQ969V3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCLNQ969V3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCLNQ969V3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCLNQ969V3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCLNQ969V3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCLNQ969V3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCLNQ969V3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCLNQ969V3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCLNQ969V3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCLNQ969V3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCLNQ969V3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCLNQ969V3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCLNQ969V3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCLNQ969V3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCLNQ969V3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCLNQ969V3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCLNQ969V3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCLNQ969V3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCLNQ969V3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCLNQ969V3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCLNQ969V3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCLNQ969V3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCLNQ969V3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCLNQ969V3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCLNQ969V3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCLNQ969V3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NCLNQ969V3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NCLNQ969V3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NCLNQ969V3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCLNQ969V3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCLNQ969V3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NCLNQ969V3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCLNQ969V3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCLNQ969V3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NCLNQ969V3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NCLNQ969V3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCLNQ969V3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCLNQ969V3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCLNQ969V3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCLNQ969V3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCLNQ969V3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCLNQ969V3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCLNQ969V3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCLNQ969V3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCLNQ969V3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCLNQ969V3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCLNQ969V3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCLNQ969V3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCLNQ969V3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCLNQ969V3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCLNQ969V3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NCLNQ969V3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCLNQ969V3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCLNQ969V3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCLNQ969V3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NCLNQ969V3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCLNQ969V3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCLNQ969V3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCLNQ969V3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCLNQ969V3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCLNQ969V3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCLNQ969V3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCLNQ969V3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.6 ms