Protein–RNA interactions for Protein: Q969I6

SLC38A4, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A4Q969I6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC38A4Q969I6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC38A4Q969I6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC38A4Q969I6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC38A4Q969I6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC38A4Q969I6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC38A4Q969I6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC38A4Q969I6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC38A4Q969I6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC38A4Q969I6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC38A4Q969I6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC38A4Q969I6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC38A4Q969I6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC38A4Q969I6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC38A4Q969I6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC38A4Q969I6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC38A4Q969I6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC38A4Q969I6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC38A4Q969I6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC38A4Q969I6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC38A4Q969I6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC38A4Q969I6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC38A4Q969I6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC38A4Q969I6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC38A4Q969I6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC38A4Q969I6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC38A4Q969I6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC38A4Q969I6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC38A4Q969I6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC38A4Q969I6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC38A4Q969I6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC38A4Q969I6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC38A4Q969I6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC38A4Q969I6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC38A4Q969I6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC38A4Q969I6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC38A4Q969I6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC38A4Q969I6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC38A4Q969I6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC38A4Q969I6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC38A4Q969I6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC38A4Q969I6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC38A4Q969I6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC38A4Q969I6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC38A4Q969I6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC38A4Q969I6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC38A4Q969I6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC38A4Q969I6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC38A4Q969I6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC38A4Q969I6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC38A4Q969I6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC38A4Q969I6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC38A4Q969I6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC38A4Q969I6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC38A4Q969I6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC38A4Q969I6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC38A4Q969I6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC38A4Q969I6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC38A4Q969I6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC38A4Q969I6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC38A4Q969I6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC38A4Q969I6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC38A4Q969I6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC38A4Q969I6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC38A4Q969I6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC38A4Q969I6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC38A4Q969I6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC38A4Q969I6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC38A4Q969I6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC38A4Q969I6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC38A4Q969I6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC38A4Q969I6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC38A4Q969I6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC38A4Q969I6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC38A4Q969I6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC38A4Q969I6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC38A4Q969I6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC38A4Q969I6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC38A4Q969I6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC38A4Q969I6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC38A4Q969I6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC38A4Q969I6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC38A4Q969I6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC38A4Q969I6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC38A4Q969I6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC38A4Q969I6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC38A4Q969I6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC38A4Q969I6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC38A4Q969I6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC38A4Q969I6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC38A4Q969I6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC38A4Q969I6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC38A4Q969I6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC38A4Q969I6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC38A4Q969I6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC38A4Q969I6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC38A4Q969I6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC38A4Q969I6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC38A4Q969I6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC38A4Q969I6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms