Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFKQ969G6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFKQ969G6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFKQ969G6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFKQ969G6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFKQ969G6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFKQ969G6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFKQ969G6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFKQ969G6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFKQ969G6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFKQ969G6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFKQ969G6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFKQ969G6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFKQ969G6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFKQ969G6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFKQ969G6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFKQ969G6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFKQ969G6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFKQ969G6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFKQ969G6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFKQ969G6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFKQ969G6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFKQ969G6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFKQ969G6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFKQ969G6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFKQ969G6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFKQ969G6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFKQ969G6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFKQ969G6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFKQ969G6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFKQ969G6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFKQ969G6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFKQ969G6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFKQ969G6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFKQ969G6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFKQ969G6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFKQ969G6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFKQ969G6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFKQ969G6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFKQ969G6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFKQ969G6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RFKQ969G6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFKQ969G6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RFKQ969G6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RFKQ969G6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
RFKQ969G6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFKQ969G6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFKQ969G6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFKQ969G6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFKQ969G6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFKQ969G6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFKQ969G6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFKQ969G6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFKQ969G6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RFKQ969G6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFKQ969G6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFKQ969G6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RFKQ969G6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFKQ969G6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFKQ969G6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFKQ969G6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFKQ969G6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFKQ969G6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFKQ969G6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFKQ969G6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFKQ969G6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFKQ969G6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFKQ969G6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFKQ969G6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFKQ969G6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFKQ969G6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFKQ969G6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFKQ969G6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFKQ969G6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFKQ969G6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RFKQ969G6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFKQ969G6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFKQ969G6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFKQ969G6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFKQ969G6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFKQ969G6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFKQ969G6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFKQ969G6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RFKQ969G6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RFKQ969G6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RFKQ969G6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RFKQ969G6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RFKQ969G6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RFKQ969G6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RFKQ969G6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RFKQ969G6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RFKQ969G6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RFKQ969G6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RFKQ969G6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RFKQ969G6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RFKQ969G6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RFKQ969G6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RFKQ969G6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RFKQ969G6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RFKQ969G6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms