Protein–RNA interactions for Protein: Q93038

TNFRSF25, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 25, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25Q93038 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNFRSF25Q93038 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNFRSF25Q93038 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNFRSF25Q93038 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNFRSF25Q93038 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNFRSF25Q93038 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNFRSF25Q93038 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNFRSF25Q93038 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNFRSF25Q93038 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNFRSF25Q93038 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TNFRSF25Q93038 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNFRSF25Q93038 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TNFRSF25Q93038 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNFRSF25Q93038 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TNFRSF25Q93038 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNFRSF25Q93038 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TNFRSF25Q93038 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNFRSF25Q93038 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNFRSF25Q93038 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNFRSF25Q93038 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNFRSF25Q93038 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNFRSF25Q93038 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNFRSF25Q93038 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNFRSF25Q93038 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNFRSF25Q93038 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNFRSF25Q93038 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNFRSF25Q93038 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNFRSF25Q93038 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNFRSF25Q93038 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNFRSF25Q93038 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNFRSF25Q93038 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNFRSF25Q93038 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNFRSF25Q93038 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNFRSF25Q93038 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNFRSF25Q93038 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNFRSF25Q93038 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNFRSF25Q93038 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNFRSF25Q93038 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNFRSF25Q93038 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNFRSF25Q93038 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNFRSF25Q93038 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNFRSF25Q93038 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNFRSF25Q93038 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNFRSF25Q93038 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
TNFRSF25Q93038 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNFRSF25Q93038 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNFRSF25Q93038 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNFRSF25Q93038 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNFRSF25Q93038 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNFRSF25Q93038 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNFRSF25Q93038 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNFRSF25Q93038 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNFRSF25Q93038 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNFRSF25Q93038 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNFRSF25Q93038 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNFRSF25Q93038 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNFRSF25Q93038 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNFRSF25Q93038 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TNFRSF25Q93038 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNFRSF25Q93038 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNFRSF25Q93038 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNFRSF25Q93038 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNFRSF25Q93038 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNFRSF25Q93038 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNFRSF25Q93038 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNFRSF25Q93038 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNFRSF25Q93038 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNFRSF25Q93038 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNFRSF25Q93038 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNFRSF25Q93038 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNFRSF25Q93038 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNFRSF25Q93038 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNFRSF25Q93038 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNFRSF25Q93038 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNFRSF25Q93038 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNFRSF25Q93038 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNFRSF25Q93038 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNFRSF25Q93038 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNFRSF25Q93038 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNFRSF25Q93038 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNFRSF25Q93038 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNFRSF25Q93038 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNFRSF25Q93038 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNFRSF25Q93038 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNFRSF25Q93038 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TNFRSF25Q93038 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TNFRSF25Q93038 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TNFRSF25Q93038 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNFRSF25Q93038 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNFRSF25Q93038 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNFRSF25Q93038 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNFRSF25Q93038 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TNFRSF25Q93038 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TNFRSF25Q93038 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNFRSF25Q93038 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNFRSF25Q93038 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNFRSF25Q93038 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNFRSF25Q93038 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNFRSF25Q93038 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNFRSF25Q93038 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms