Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GATA6Q92908 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GATA6Q92908 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GATA6Q92908 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GATA6Q92908 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GATA6Q92908 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GATA6Q92908 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GATA6Q92908 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GATA6Q92908 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GATA6Q92908 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GATA6Q92908 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GATA6Q92908 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GATA6Q92908 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GATA6Q92908 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GATA6Q92908 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GATA6Q92908 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GATA6Q92908 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GATA6Q92908 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GATA6Q92908 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GATA6Q92908 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GATA6Q92908 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GATA6Q92908 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GATA6Q92908 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GATA6Q92908 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GATA6Q92908 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GATA6Q92908 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GATA6Q92908 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GATA6Q92908 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GATA6Q92908 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GATA6Q92908 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GATA6Q92908 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GATA6Q92908 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GATA6Q92908 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GATA6Q92908 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GATA6Q92908 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GATA6Q92908 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GATA6Q92908 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GATA6Q92908 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GATA6Q92908 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GATA6Q92908 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GATA6Q92908 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GATA6Q92908 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GATA6Q92908 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GATA6Q92908 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GATA6Q92908 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GATA6Q92908 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GATA6Q92908 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GATA6Q92908 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GATA6Q92908 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GATA6Q92908 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GATA6Q92908 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GATA6Q92908 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GATA6Q92908 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GATA6Q92908 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GATA6Q92908 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GATA6Q92908 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GATA6Q92908 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GATA6Q92908 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GATA6Q92908 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GATA6Q92908 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GATA6Q92908 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GATA6Q92908 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GATA6Q92908 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GATA6Q92908 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GATA6Q92908 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GATA6Q92908 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GATA6Q92908 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GATA6Q92908 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GATA6Q92908 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GATA6Q92908 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GATA6Q92908 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GATA6Q92908 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GATA6Q92908 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GATA6Q92908 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GATA6Q92908 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GATA6Q92908 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GATA6Q92908 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GATA6Q92908 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GATA6Q92908 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GATA6Q92908 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GATA6Q92908 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GATA6Q92908 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GATA6Q92908 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GATA6Q92908 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GATA6Q92908 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GATA6Q92908 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GATA6Q92908 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GATA6Q92908 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GATA6Q92908 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GATA6Q92908 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GATA6Q92908 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GATA6Q92908 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GATA6Q92908 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GATA6Q92908 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GATA6Q92908 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GATA6Q92908 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GATA6Q92908 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GATA6Q92908 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GATA6Q92908 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GATA6Q92908 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms