Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EDAQ92838 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EDAQ92838 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EDAQ92838 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EDAQ92838 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDAQ92838 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDAQ92838 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDAQ92838 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDAQ92838 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDAQ92838 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDAQ92838 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
EDAQ92838 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
EDAQ92838 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDAQ92838 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDAQ92838 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EDAQ92838 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EDAQ92838 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EDAQ92838 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EDAQ92838 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EDAQ92838 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
EDAQ92838 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
EDAQ92838 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EDAQ92838 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EDAQ92838 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EDAQ92838 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
EDAQ92838 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EDAQ92838 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EDAQ92838 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EDAQ92838 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EDAQ92838 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EDAQ92838 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EDAQ92838 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EDAQ92838 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EDAQ92838 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EDAQ92838 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EDAQ92838 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EDAQ92838 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EDAQ92838 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EDAQ92838 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EDAQ92838 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EDAQ92838 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EDAQ92838 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EDAQ92838 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
EDAQ92838 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EDAQ92838 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EDAQ92838 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EDAQ92838 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
EDAQ92838 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
EDAQ92838 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EDAQ92838 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EDAQ92838 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EDAQ92838 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EDAQ92838 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EDAQ92838 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EDAQ92838 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EDAQ92838 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EDAQ92838 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EDAQ92838 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EDAQ92838 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EDAQ92838 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EDAQ92838 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EDAQ92838 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EDAQ92838 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EDAQ92838 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EDAQ92838 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EDAQ92838 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EDAQ92838 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EDAQ92838 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EDAQ92838 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EDAQ92838 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EDAQ92838 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EDAQ92838 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
EDAQ92838 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
EDAQ92838 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EDAQ92838 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EDAQ92838 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EDAQ92838 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EDAQ92838 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EDAQ92838 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EDAQ92838 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EDAQ92838 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EDAQ92838 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EDAQ92838 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EDAQ92838 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
EDAQ92838 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EDAQ92838 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EDAQ92838 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EDAQ92838 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EDAQ92838 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
EDAQ92838 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EDAQ92838 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EDAQ92838 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EDAQ92838 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EDAQ92838 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EDAQ92838 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EDAQ92838 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EDAQ92838 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EDAQ92838 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
EDAQ92838 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EDAQ92838 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms