Protein–RNA interactions for Protein: Q92784

DPF3, Zinc finger protein DPF3, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPF3Q92784 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DPF3Q92784 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DPF3Q92784 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DPF3Q92784 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DPF3Q92784 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DPF3Q92784 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DPF3Q92784 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
DPF3Q92784 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
DPF3Q92784 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DPF3Q92784 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DPF3Q92784 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DPF3Q92784 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DPF3Q92784 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DPF3Q92784 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
DPF3Q92784 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DPF3Q92784 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DPF3Q92784 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DPF3Q92784 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DPF3Q92784 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DPF3Q92784 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DPF3Q92784 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DPF3Q92784 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DPF3Q92784 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DPF3Q92784 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DPF3Q92784 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DPF3Q92784 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
DPF3Q92784 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DPF3Q92784 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DPF3Q92784 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DPF3Q92784 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
DPF3Q92784 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DPF3Q92784 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DPF3Q92784 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DPF3Q92784 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DPF3Q92784 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DPF3Q92784 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DPF3Q92784 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DPF3Q92784 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DPF3Q92784 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DPF3Q92784 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DPF3Q92784 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DPF3Q92784 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DPF3Q92784 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DPF3Q92784 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DPF3Q92784 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DPF3Q92784 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DPF3Q92784 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DPF3Q92784 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
DPF3Q92784 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DPF3Q92784 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DPF3Q92784 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DPF3Q92784 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DPF3Q92784 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DPF3Q92784 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DPF3Q92784 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DPF3Q92784 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DPF3Q92784 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DPF3Q92784 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DPF3Q92784 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
DPF3Q92784 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DPF3Q92784 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DPF3Q92784 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DPF3Q92784 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DPF3Q92784 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DPF3Q92784 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DPF3Q92784 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DPF3Q92784 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DPF3Q92784 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DPF3Q92784 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
DPF3Q92784 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DPF3Q92784 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DPF3Q92784 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DPF3Q92784 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DPF3Q92784 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DPF3Q92784 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
DPF3Q92784 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DPF3Q92784 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DPF3Q92784 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DPF3Q92784 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DPF3Q92784 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DPF3Q92784 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
DPF3Q92784 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DPF3Q92784 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
DPF3Q92784 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DPF3Q92784 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DPF3Q92784 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DPF3Q92784 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DPF3Q92784 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DPF3Q92784 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DPF3Q92784 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
DPF3Q92784 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DPF3Q92784 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
DPF3Q92784 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DPF3Q92784 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DPF3Q92784 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DPF3Q92784 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DPF3Q92784 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DPF3Q92784 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DPF3Q92784 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DPF3Q92784 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms