Protein–RNA interactions for Protein: Q92581

SLC9A6, Sodium/hydrogen exchanger 6, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A6Q92581 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A6Q92581 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A6Q92581 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A6Q92581 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC9A6Q92581 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC9A6Q92581 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC9A6Q92581 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC9A6Q92581 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC9A6Q92581 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC9A6Q92581 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A6Q92581 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A6Q92581 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A6Q92581 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A6Q92581 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A6Q92581 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A6Q92581 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A6Q92581 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A6Q92581 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A6Q92581 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A6Q92581 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A6Q92581 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A6Q92581 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A6Q92581 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A6Q92581 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A6Q92581 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A6Q92581 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A6Q92581 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A6Q92581 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A6Q92581 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A6Q92581 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A6Q92581 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A6Q92581 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A6Q92581 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A6Q92581 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A6Q92581 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A6Q92581 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A6Q92581 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A6Q92581 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A6Q92581 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A6Q92581 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A6Q92581 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A6Q92581 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A6Q92581 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A6Q92581 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A6Q92581 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A6Q92581 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A6Q92581 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A6Q92581 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A6Q92581 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A6Q92581 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A6Q92581 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A6Q92581 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A6Q92581 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A6Q92581 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A6Q92581 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A6Q92581 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A6Q92581 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A6Q92581 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A6Q92581 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A6Q92581 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A6Q92581 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A6Q92581 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A6Q92581 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A6Q92581 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A6Q92581 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A6Q92581 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A6Q92581 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A6Q92581 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A6Q92581 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A6Q92581 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A6Q92581 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9A6Q92581 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9A6Q92581 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9A6Q92581 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9A6Q92581 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9A6Q92581 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9A6Q92581 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9A6Q92581 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9A6Q92581 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9A6Q92581 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9A6Q92581 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9A6Q92581 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9A6Q92581 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9A6Q92581 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9A6Q92581 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9A6Q92581 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9A6Q92581 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9A6Q92581 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9A6Q92581 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A6Q92581 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A6Q92581 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A6Q92581 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A6Q92581 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A6Q92581 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A6Q92581 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A6Q92581 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A6Q92581 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A6Q92581 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A6Q92581 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC9A6Q92581 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms