Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF1

PSPC1, Paraspeckle component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1Q8WXF1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSPC1Q8WXF1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSPC1Q8WXF1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PSPC1Q8WXF1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSPC1Q8WXF1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSPC1Q8WXF1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSPC1Q8WXF1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PSPC1Q8WXF1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSPC1Q8WXF1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSPC1Q8WXF1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSPC1Q8WXF1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSPC1Q8WXF1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PSPC1Q8WXF1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PSPC1Q8WXF1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSPC1Q8WXF1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSPC1Q8WXF1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSPC1Q8WXF1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSPC1Q8WXF1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSPC1Q8WXF1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSPC1Q8WXF1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSPC1Q8WXF1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PSPC1Q8WXF1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PSPC1Q8WXF1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PSPC1Q8WXF1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSPC1Q8WXF1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSPC1Q8WXF1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSPC1Q8WXF1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PSPC1Q8WXF1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PSPC1Q8WXF1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PSPC1Q8WXF1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSPC1Q8WXF1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSPC1Q8WXF1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSPC1Q8WXF1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSPC1Q8WXF1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSPC1Q8WXF1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSPC1Q8WXF1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSPC1Q8WXF1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSPC1Q8WXF1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSPC1Q8WXF1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSPC1Q8WXF1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSPC1Q8WXF1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSPC1Q8WXF1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSPC1Q8WXF1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSPC1Q8WXF1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSPC1Q8WXF1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PSPC1Q8WXF1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PSPC1Q8WXF1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PSPC1Q8WXF1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PSPC1Q8WXF1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PSPC1Q8WXF1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PSPC1Q8WXF1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PSPC1Q8WXF1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PSPC1Q8WXF1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PSPC1Q8WXF1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PSPC1Q8WXF1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PSPC1Q8WXF1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PSPC1Q8WXF1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PSPC1Q8WXF1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PSPC1Q8WXF1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PSPC1Q8WXF1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PSPC1Q8WXF1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PSPC1Q8WXF1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PSPC1Q8WXF1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PSPC1Q8WXF1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PSPC1Q8WXF1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PSPC1Q8WXF1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PSPC1Q8WXF1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PSPC1Q8WXF1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PSPC1Q8WXF1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PSPC1Q8WXF1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PSPC1Q8WXF1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PSPC1Q8WXF1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PSPC1Q8WXF1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PSPC1Q8WXF1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PSPC1Q8WXF1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PSPC1Q8WXF1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PSPC1Q8WXF1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSPC1Q8WXF1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSPC1Q8WXF1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSPC1Q8WXF1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSPC1Q8WXF1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSPC1Q8WXF1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSPC1Q8WXF1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSPC1Q8WXF1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PSPC1Q8WXF1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PSPC1Q8WXF1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PSPC1Q8WXF1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PSPC1Q8WXF1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PSPC1Q8WXF1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PSPC1Q8WXF1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSPC1Q8WXF1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSPC1Q8WXF1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSPC1Q8WXF1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSPC1Q8WXF1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSPC1Q8WXF1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSPC1Q8WXF1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSPC1Q8WXF1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSPC1Q8WXF1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSPC1Q8WXF1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSPC1Q8WXF1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
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