Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCG3Q8WXD2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCG3Q8WXD2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCG3Q8WXD2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCG3Q8WXD2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCG3Q8WXD2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCG3Q8WXD2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCG3Q8WXD2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCG3Q8WXD2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCG3Q8WXD2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCG3Q8WXD2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCG3Q8WXD2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCG3Q8WXD2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCG3Q8WXD2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCG3Q8WXD2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCG3Q8WXD2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCG3Q8WXD2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCG3Q8WXD2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCG3Q8WXD2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SCG3Q8WXD2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCG3Q8WXD2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCG3Q8WXD2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SCG3Q8WXD2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCG3Q8WXD2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCG3Q8WXD2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCG3Q8WXD2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCG3Q8WXD2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCG3Q8WXD2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCG3Q8WXD2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCG3Q8WXD2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCG3Q8WXD2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCG3Q8WXD2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCG3Q8WXD2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCG3Q8WXD2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCG3Q8WXD2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCG3Q8WXD2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCG3Q8WXD2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCG3Q8WXD2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCG3Q8WXD2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCG3Q8WXD2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCG3Q8WXD2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SCG3Q8WXD2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SCG3Q8WXD2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCG3Q8WXD2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCG3Q8WXD2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCG3Q8WXD2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCG3Q8WXD2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCG3Q8WXD2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCG3Q8WXD2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCG3Q8WXD2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCG3Q8WXD2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCG3Q8WXD2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SCG3Q8WXD2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCG3Q8WXD2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SCG3Q8WXD2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCG3Q8WXD2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCG3Q8WXD2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCG3Q8WXD2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCG3Q8WXD2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCG3Q8WXD2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCG3Q8WXD2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SCG3Q8WXD2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCG3Q8WXD2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCG3Q8WXD2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCG3Q8WXD2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCG3Q8WXD2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCG3Q8WXD2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCG3Q8WXD2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCG3Q8WXD2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCG3Q8WXD2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCG3Q8WXD2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCG3Q8WXD2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCG3Q8WXD2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCG3Q8WXD2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCG3Q8WXD2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SCG3Q8WXD2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCG3Q8WXD2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCG3Q8WXD2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCG3Q8WXD2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCG3Q8WXD2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCG3Q8WXD2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCG3Q8WXD2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCG3Q8WXD2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCG3Q8WXD2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCG3Q8WXD2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCG3Q8WXD2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCG3Q8WXD2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCG3Q8WXD2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCG3Q8WXD2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCG3Q8WXD2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCG3Q8WXD2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCG3Q8WXD2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCG3Q8WXD2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SCG3Q8WXD2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCG3Q8WXD2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCG3Q8WXD2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCG3Q8WXD2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCG3Q8WXD2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCG3Q8WXD2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCG3Q8WXD2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms