Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI1

LMO7, LIM domain only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7Q8WWI1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
LMO7Q8WWI1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
LMO7Q8WWI1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
LMO7Q8WWI1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
LMO7Q8WWI1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC32.36■■■□□ 2.77
LMO7Q8WWI1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
LMO7Q8WWI1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
LMO7Q8WWI1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
LMO7Q8WWI1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
LMO7Q8WWI1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
LMO7Q8WWI1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
LMO7Q8WWI1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
LMO7Q8WWI1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
LMO7Q8WWI1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
LMO7Q8WWI1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
LMO7Q8WWI1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
LMO7Q8WWI1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
LMO7Q8WWI1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
LMO7Q8WWI1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
LMO7Q8WWI1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
LMO7Q8WWI1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
LMO7Q8WWI1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
LMO7Q8WWI1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
LMO7Q8WWI1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
LMO7Q8WWI1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
LMO7Q8WWI1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
LMO7Q8WWI1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
LMO7Q8WWI1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
LMO7Q8WWI1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
LMO7Q8WWI1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
LMO7Q8WWI1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
LMO7Q8WWI1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
LMO7Q8WWI1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
LMO7Q8WWI1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
LMO7Q8WWI1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
LMO7Q8WWI1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
LMO7Q8WWI1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
LMO7Q8WWI1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC32.28■■■□□ 2.76
LMO7Q8WWI1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
LMO7Q8WWI1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
LMO7Q8WWI1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
LMO7Q8WWI1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
LMO7Q8WWI1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
LMO7Q8WWI1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
LMO7Q8WWI1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
LMO7Q8WWI1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
LMO7Q8WWI1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
LMO7Q8WWI1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
LMO7Q8WWI1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
LMO7Q8WWI1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
LMO7Q8WWI1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
LMO7Q8WWI1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
LMO7Q8WWI1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
LMO7Q8WWI1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
LMO7Q8WWI1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
LMO7Q8WWI1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
LMO7Q8WWI1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
LMO7Q8WWI1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
LMO7Q8WWI1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
LMO7Q8WWI1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
LMO7Q8WWI1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
LMO7Q8WWI1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
LMO7Q8WWI1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
LMO7Q8WWI1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
LMO7Q8WWI1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
LMO7Q8WWI1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC32.23■■■□□ 2.75
LMO7Q8WWI1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
LMO7Q8WWI1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
LMO7Q8WWI1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
LMO7Q8WWI1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
LMO7Q8WWI1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
LMO7Q8WWI1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
LMO7Q8WWI1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
LMO7Q8WWI1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC32.22■■■□□ 2.75
LMO7Q8WWI1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
LMO7Q8WWI1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
LMO7Q8WWI1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
LMO7Q8WWI1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
LMO7Q8WWI1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
LMO7Q8WWI1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
LMO7Q8WWI1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
LMO7Q8WWI1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
LMO7Q8WWI1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
LMO7Q8WWI1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
LMO7Q8WWI1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
LMO7Q8WWI1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
LMO7Q8WWI1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
LMO7Q8WWI1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
LMO7Q8WWI1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
LMO7Q8WWI1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
LMO7Q8WWI1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
LMO7Q8WWI1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
LMO7Q8WWI1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
LMO7Q8WWI1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
LMO7Q8WWI1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
LMO7Q8WWI1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
LMO7Q8WWI1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
LMO7Q8WWI1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
LMO7Q8WWI1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
LMO7Q8WWI1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms