Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF1

C1orf54, Uncharacterized protein C1orf54, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf54Q8WWF1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1orf54Q8WWF1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1orf54Q8WWF1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
C1orf54Q8WWF1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1orf54Q8WWF1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1orf54Q8WWF1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1orf54Q8WWF1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1orf54Q8WWF1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C1orf54Q8WWF1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C1orf54Q8WWF1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C1orf54Q8WWF1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C1orf54Q8WWF1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C1orf54Q8WWF1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C1orf54Q8WWF1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C1orf54Q8WWF1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C1orf54Q8WWF1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C1orf54Q8WWF1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C1orf54Q8WWF1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C1orf54Q8WWF1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C1orf54Q8WWF1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C1orf54Q8WWF1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C1orf54Q8WWF1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C1orf54Q8WWF1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C1orf54Q8WWF1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1orf54Q8WWF1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1orf54Q8WWF1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1orf54Q8WWF1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1orf54Q8WWF1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1orf54Q8WWF1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C1orf54Q8WWF1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C1orf54Q8WWF1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C1orf54Q8WWF1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C1orf54Q8WWF1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C1orf54Q8WWF1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C1orf54Q8WWF1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C1orf54Q8WWF1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C1orf54Q8WWF1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C1orf54Q8WWF1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
C1orf54Q8WWF1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
C1orf54Q8WWF1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
C1orf54Q8WWF1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C1orf54Q8WWF1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C1orf54Q8WWF1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C1orf54Q8WWF1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C1orf54Q8WWF1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C1orf54Q8WWF1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1orf54Q8WWF1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1orf54Q8WWF1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1orf54Q8WWF1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1orf54Q8WWF1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1orf54Q8WWF1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1orf54Q8WWF1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1orf54Q8WWF1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1orf54Q8WWF1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1orf54Q8WWF1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
C1orf54Q8WWF1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1orf54Q8WWF1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
C1orf54Q8WWF1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1orf54Q8WWF1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C1orf54Q8WWF1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C1orf54Q8WWF1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C1orf54Q8WWF1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C1orf54Q8WWF1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
C1orf54Q8WWF1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C1orf54Q8WWF1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C1orf54Q8WWF1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C1orf54Q8WWF1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C1orf54Q8WWF1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C1orf54Q8WWF1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
C1orf54Q8WWF1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1orf54Q8WWF1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1orf54Q8WWF1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1orf54Q8WWF1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1orf54Q8WWF1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1orf54Q8WWF1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1orf54Q8WWF1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1orf54Q8WWF1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
C1orf54Q8WWF1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1orf54Q8WWF1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1orf54Q8WWF1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1orf54Q8WWF1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1orf54Q8WWF1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1orf54Q8WWF1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1orf54Q8WWF1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C1orf54Q8WWF1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C1orf54Q8WWF1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
C1orf54Q8WWF1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
C1orf54Q8WWF1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1orf54Q8WWF1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1orf54Q8WWF1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1orf54Q8WWF1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1orf54Q8WWF1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1orf54Q8WWF1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1orf54Q8WWF1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1orf54Q8WWF1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1orf54Q8WWF1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1orf54Q8WWF1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1orf54Q8WWF1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1orf54Q8WWF1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1orf54Q8WWF1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
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