Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVS4

WDR60, WD repeat-containing protein 60, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR60Q8WVS4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
WDR60Q8WVS4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
WDR60Q8WVS4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
WDR60Q8WVS4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
WDR60Q8WVS4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
WDR60Q8WVS4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
WDR60Q8WVS4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
WDR60Q8WVS4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
WDR60Q8WVS4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
WDR60Q8WVS4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
WDR60Q8WVS4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
WDR60Q8WVS4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
WDR60Q8WVS4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
WDR60Q8WVS4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
WDR60Q8WVS4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
WDR60Q8WVS4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
WDR60Q8WVS4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
WDR60Q8WVS4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR60Q8WVS4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR60Q8WVS4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR60Q8WVS4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR60Q8WVS4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR60Q8WVS4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR60Q8WVS4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR60Q8WVS4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR60Q8WVS4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR60Q8WVS4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR60Q8WVS4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR60Q8WVS4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR60Q8WVS4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR60Q8WVS4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
WDR60Q8WVS4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
WDR60Q8WVS4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
WDR60Q8WVS4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
WDR60Q8WVS4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
WDR60Q8WVS4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
WDR60Q8WVS4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
WDR60Q8WVS4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
WDR60Q8WVS4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
WDR60Q8WVS4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
WDR60Q8WVS4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR60Q8WVS4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR60Q8WVS4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR60Q8WVS4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR60Q8WVS4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR60Q8WVS4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR60Q8WVS4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR60Q8WVS4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
WDR60Q8WVS4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
WDR60Q8WVS4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
WDR60Q8WVS4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
WDR60Q8WVS4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
WDR60Q8WVS4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
WDR60Q8WVS4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
WDR60Q8WVS4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
WDR60Q8WVS4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR60Q8WVS4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR60Q8WVS4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR60Q8WVS4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR60Q8WVS4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR60Q8WVS4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR60Q8WVS4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR60Q8WVS4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR60Q8WVS4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR60Q8WVS4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR60Q8WVS4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR60Q8WVS4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR60Q8WVS4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR60Q8WVS4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR60Q8WVS4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR60Q8WVS4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR60Q8WVS4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR60Q8WVS4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR60Q8WVS4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
WDR60Q8WVS4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
WDR60Q8WVS4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
WDR60Q8WVS4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
WDR60Q8WVS4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
WDR60Q8WVS4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
WDR60Q8WVS4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
WDR60Q8WVS4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
WDR60Q8WVS4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
WDR60Q8WVS4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR60Q8WVS4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR60Q8WVS4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR60Q8WVS4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR60Q8WVS4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR60Q8WVS4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR60Q8WVS4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR60Q8WVS4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR60Q8WVS4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR60Q8WVS4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR60Q8WVS4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR60Q8WVS4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR60Q8WVS4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR60Q8WVS4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR60Q8WVS4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR60Q8WVS4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR60Q8WVS4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR60Q8WVS4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms